RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 ORMDL3Q8N138 153 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM256Q8N2U0 113 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 NACAE9PAV3 2078 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 NOTCH1P46531 2555 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GV90 55 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 F2Z2F3 143 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 GNRH2O43555 120 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFC2O95298 119 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 HLA-DQA1P01909 254 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 CD7P09564 240 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 NTF3P20783 257 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 EMP1P54849 157 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 SPINK13Q1W4C9 94 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-214ENST00000530727 Q0VG73 95 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 MUC21A0A140T8X8 626 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GVX0 72 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 LST1O00453 97 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 NUPR1O60356 82 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM17P0DL12 118 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 LUZP6Q538Z0 58 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 FAM104BQ5XKR9 115 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 Q8N976 141 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 VPS25Q9BRG1 176 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRC-214ENST00000530727 PRR34Q9NV39 138 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 U3KQK5 164 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 DNHD1Q96M86 4753 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRC-214ENST00000530727 H3BVH4 76 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRC-214ENST00000530727 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 COL7A1Q02388 2944 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 COX7A2LO14548 114 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 PRM2P04554 102 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 EVI2AP22794 236 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 AMN1Q8IY45 258 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 TENM3Q9P273 2699 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-214ENST00000530727 AZU1P20160 251 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 C3orf56Q8N813 242 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-214ENST00000530727 D6R8Y8 96 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-214ENST00000530727 BPY2O14599 106 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 IQCJQ1A5X6 159 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 PCP2Q8IVA1 136 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 C15orf56Q8N910 161 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 K7EP13 123 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 NPYP01303 97 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 A0A096LNJ9 63 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 FAM168BA1KXE4 195 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 M0R2P5 195 aa2.72□□□□□ -1.97
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