RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 C10orf113Q5VZT2 155 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A0G2JMZ2 1700 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCNTO95613 3336 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 GINS3Q9BRX5 216 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 DISP2A7MBM2 1401 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 TPM2P07951 284 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARMC1Q9NVT9 282 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 TCRAP04437 139 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ATG12O94817 140 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 LELP1Q5T871 98 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SZT2Q5T011 3432 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 MGPP08493 103 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 UBE2G1P62253 170 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 FDCSPQ8NFU4 85 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC01600Q96MT4 127 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SIX6O95475 246 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CBLN1P23435 193 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPRR4Q96PI1 79 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 NIPSNAP2O75323 286 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 HLA-DRB4P13762 266 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CEBPGP53567 150 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00846Q9NV44 126 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYH2Q9UKX2 1941 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 NWD2Q9ULI1 1742 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 ALKQ9UM73 1620 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 CLIP1P30622 1438 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 LOC400499M0QZD8 3231 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 KDM5CP41229 1560 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM107AO95990 144 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 AQP10Q96PS8 301 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 COPZ2Q9P299 210 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 MED31Q9Y3C7 131 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGLC7A0M8Q6 106 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR13C6PQ8NH95 151 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 E7EQ34 232 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 SMIM24O75264 130 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 NEFHP12036 1026 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCL7P80098 99 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 CLLU1Q5K131 121 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 C10orf128Q5T292 105 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 SS18L2Q9UHA2 77 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 SFT2D2O95562 160 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-4□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRLHP81277 87 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 DYDC1Q8WWB3 177 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRO1933Q9H354 126 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZFYVE9O95405 1425 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM24BQ8N5W8 94 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERCC6Q03468 1493 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYH7P12883 1935 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC32Q9BV29 185 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 V9GYQ6 96 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARHGEF10O15013 1369 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 CEP250Q9BV73 2442 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAGI2Q86UL8 1455 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFT140Q96RY7 1462 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 SEC11AP67812 179 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRAP1Q96NZ9 151 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAIMQ9NVQ4 179 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-162P-201ENST00000516228 NLRP1Q9C000 1473 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM238C9JI98 176 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 HCG22E2RYF7 251 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFNA1P01562 189 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 CFAP53Q96M91 514 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 CALML5Q9NZT1 146 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTC9CQ8N5M4 171 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-162P-201ENST00000516228 SAR1AQ9NR31 198 aa-4.05□□□□□ -3.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.9 ms