RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCP2Q8IVA1 136 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIGD1BQ9P298 99 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 APOMO95445 188 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRSS2P07478 247 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPINK8P0C7L1 97 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MALP21145 153 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XCL1P47992 114 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RMI2Q96E14 147 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COX7A2LO14548 114 aa8.36□□□□□ -1.07
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 CTAG1AP78358 180 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.36□□□□□ -1.07
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00587B1AMM8 73 aa8.35□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.35□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COX6A2Q02221 97 aa8.35□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRR34Q9NV39 138 aa8.35□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HERV-K104P63124 156 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSD52Q0P140 79 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.34□□□□□ -1.07
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CFAP161Q6P656 301 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C5orf38Q86SI9 138 aa8.33□□□□□ -1.08
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIST1H4GQ99525 98 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TENM3Q9P273 2699 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.32□□□□□ -1.08
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.32□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.32□□□□□ -1.08
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.31□□□□□ -1.08
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q9H8V8 135 aa8.31□□□□□ -1.08
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTTG1IPP53801 180 aa8.3□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ENHOQ6UWT2 76 aa8.3□□□□□ -1.08
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q8IZM0 81 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TIMM17BO60830 172 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TTC32Q5I0X7 151 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.28□□□□□ -1.08
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXI1Q12951 378 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CEND1Q8N111 149 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.26□□□□□ -1.09
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 MUC7Q8TAX7 377 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F8WDY8 70 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IFITM1P13164 125 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q9HAA7 133 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPAG11BQ08648 103 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPANXCQ9NY87 97 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSCAO43653 123 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMIM13P0DJ93 91 aa8.22□□□□□ -1.09
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