RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 K7EQD1 137 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 LINC01620Q4KN68 170 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 IFITM1P13164 125 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 COX6A2Q02221 97 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 HIVEP1P15822 2718 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 TMEM262E9PQX1 116 aa9.15□□□□□ -0.94
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PRAME-213ENST00000492657 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PRAME-213ENST00000492657 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.15□□□□□ -0.94
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PRAME-213ENST00000492657 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
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PRAME-213ENST00000492657 C2orf82Q6UX34 121 aa9.13□□□□□ -0.95
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PRAME-213ENST00000492657 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 ATXN8Q156A1 80 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.12□□□□□ -0.95
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PRAME-213ENST00000492657 C16orf74Q96GX8 76 aa9.12□□□□□ -0.95
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PRAME-213ENST00000492657 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.1□□□□□ -0.95
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PRAME-213ENST00000492657 MIAQ16674 131 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 TIRAPP58753 221 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 SPANXCQ9NY87 97 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-213ENST00000492657 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.09□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.09□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.09□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 INAFM1C9JVW0 142 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.08□□□□□ -0.96
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PRAME-213ENST00000492657 DEFB130AP0DP74 79 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 FHL2Q14192 279 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 TMEM243Q9BU79 118 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 COX6CP09669 75 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 HERVK_113P63121 156 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 UBE2L6O14933 153 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 Q9H8V8 135 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA1O15239 70 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 M0QXV9 152 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 F5H768 121 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-213ENST00000492657 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.02□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 DEFB4AO15263 64 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 TIMM17BO60830 172 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 X6R8D5 127 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.01□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 PRIMA1Q86XR5 153 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 A0A096LPF7 62 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 LST1O00453 97 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 GYPEP15421 78 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 H3BT86 120 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 DEFB135Q30KP9 77 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 Q6Q795 121 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-213ENST00000492657 F8P00451 2351 aa8.97□□□□□ -0.97
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