RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486827.1

RAD51C-210, Transcript of RAD51 paralog C, humanhuman

TSL 2

Gene RAD51C, Length 1,609 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51C-210ENST00000486827 GCSHP23434 173 aa9.16□□□□□ -0.94
RAD51C-210ENST00000486827 CEND1Q8N111 149 aa9.16□□□□□ -0.94
RAD51C-210ENST00000486827 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.15□□□□□ -0.94
RAD51C-210ENST00000486827 K7EP13 123 aa9.15□□□□□ -0.94
RAD51C-210ENST00000486827 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RAD51C-210ENST00000486827 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.15□□□□□ -0.94
RAD51C-210ENST00000486827 LEPROTO15243 131 aa9.14□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.14□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.14□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 RTL8CO15255 209 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 PKHD1P08F94 4074 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 A0A0J9YY99 117 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 J3QQQ9 107 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 UBE2D1P51668 147 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 Q6ZR54 194 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.12□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 C9orf118A6NHY6 69 aa9.12□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.12□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 HIST1H4GQ99525 98 aa9.12□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 PKD1P98161 4303 aa9.12□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 UBE2V1Q13404 147 aa9.11□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.11□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.1□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 SMIM13P0DJ93 91 aa9.1□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 TIRAPP58753 221 aa9.1□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.1□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 TMEM243Q9BU79 118 aa9.1□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 CCL25O15444 150 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 VAMP3Q15836 100 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 A0A1B0GVY2 172 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 A0A1B0GWB2 263 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 H7C423 109 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 K7ERJ3 54 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 PTTG1IPP53801 180 aa9.09□□□□□ -0.95
RAD51C-210ENST00000486827 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.08□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.08□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.08□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.08□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.08□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.08□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 H3BUT2 72 aa9.07□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 RAB37Q96AX2 223 aa9.07□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 HERC2O95714 4834 aa9.07□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 A0A096LPF7 62 aa9.06□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.06□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.06□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 ESRGQ1W209 222 aa9.06□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.06□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.06□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.06□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 SPINK8P0C7L1 97 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 COX6A2Q02221 97 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 UBE2L6O14933 153 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 IGHV3-30P01768 117 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 GYPEP15421 78 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 HERVK_113P63121 156 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 PRO0255Q9UI72 69 aa9.05□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 A0A1W2PPM0 123 aa9.04□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 CCL18P55774 89 aa9.04□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.03□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 A0A0J9YXY3 114 aa9.03□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.03□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 GAGE6Q13070 117 aa9.03□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.03□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 TMEM101Q96IK0 257 aa9.03□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.02□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 LITAFQ99732 161 aa9.02□□□□□ -0.96
RAD51C-210ENST00000486827 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.02□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.02□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 A6NJY4 79 aa9.02□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 H3BNG1 76 aa9.02□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 K7EP34 96 aa9.02□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 Q9H8V8 135 aa9.02□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.02□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 PAX4O43316 350 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 TNP2Q05952 138 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.01□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 GAGE10A6NGK3 116 aa9□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 SMIM1B2RUZ4 78 aa9□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 TMEM238C9JI98 176 aa9□□□□□ -0.97
RAD51C-210ENST00000486827 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms