RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 BAGE3Q86Y29 109 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf78Q9BR46 151 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM262E9PQX1 116 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 SERF1AO75920 110 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R17O96001 155 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00614P0C842 121 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRC-211ENST00000484135 COTL1Q14019 142 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRC-211ENST00000484135 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 CCL18P55774 89 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 Q0VG73 95 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 LAGE3Q14657 143 aa3.17□□□□□ -1.9
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PTPRC-211ENST00000484135 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N976 141 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.17□□□□□ -1.9
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PTPRC-211ENST00000484135 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.17□□□□□ -1.9
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PTPRC-211ENST00000484135 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 M0R2N4 97 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2L6O14933 153 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 HSBP1O75506 76 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 LY6G6CO95867 125 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 ESDP10768 282 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-211ENST00000484135 FABP4P15090 132 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-211ENST00000484135 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 A0A096LNJ9 63 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-211ENST00000484135 FGF6P10767 208 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 MPV17L2Q567V2 206 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-211ENST00000484135 LINC01546A6NGU7 62 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 SIVA1O15304 175 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 HBDP02042 147 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 SEC61GP60059 68 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 RBX1P62877 108 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZUT4 128 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 FAM104AQ969W3 186 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-211ENST00000484135 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-211ENST00000484135 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-211ENST00000484135 IGIPA6NJ69 53 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 S100A2P29034 98 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 TCTAP57738 103 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP10-8P60410 259 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-211ENST00000484135 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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