RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477187.1

C4orf17-202, Transcript of chromosome 4 open reading frame 17, humanhuman

TSL 2

Gene C4orf17, Length 1,803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17-202ENST00000477187 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 CUBNO60494 3623 aa6.27□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 GAGE7O76087 117 aa6.27□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 GAGE12FP0CL80 117 aa6.27□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 GAGE12GP0CL81 117 aa6.27□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 GAGE12IP0CL82 117 aa6.27□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 Q9H8V8 135 aa6.27□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.27□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 UBE2L6O14933 153 aa6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 DAND5Q8N907 189 aa6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 LINC01600Q96MT4 127 aa6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 TMEM243Q9BU79 118 aa6.26□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.25□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.25□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 F5H768 121 aa6.25□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 CIDEAO60543 219 aa6.25□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.25□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.25□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 HILS1P60008 231 aa6.25□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.25□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 H7C423 109 aa6.24□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 COX6CP09669 75 aa6.24□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 DNHD1Q96M86 4753 aa6.24□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 JMJD1CQ15652 2540 aa6.24□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.23□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.23□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 COPS9Q8WXC6 57 aa6.23□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 SMR3AQ99954 134 aa6.23□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 HIVEP2P31629 2446 aa6.23□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 LST1O00453 97 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 XGP55808 180 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 HERV-K104P63124 156 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 A0A0U1RRA0 63 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 TMEM262E9PQX1 116 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 H3BT86 120 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 LY6G6DO95868 133 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 MT-ATP8P03928 68 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 FHL2Q14192 279 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 CLEC2BQ92478 149 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 MDFIQ99750 246 aa6.22□□□□□ -1.41
C4orf17-202ENST00000477187 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 GAGE6Q13070 117 aa6.21□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 C2orf82Q6UX34 121 aa6.21□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 UBE2WQ96B02 151 aa6.21□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.21□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.2□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 KRTAP10-3P60369 221 aa6.2□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 COX7B2Q8TF08 81 aa6.2□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.19□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.19□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 PF4P02776 101 aa6.19□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.19□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.19□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.19□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.19□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 COL6A5A8TX70 2615 aa6.19□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 INAFM1C9JVW0 142 aa6.18□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 COX7A2LO14548 114 aa6.18□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.18□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.18□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.18□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 A0A1B0GV72 72 aa6.18□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 CRLF1O75462 422 aa6.18□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.18□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.17□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 DEFB130BP0DP73 79 aa6.17□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 DEFB130AP0DP74 79 aa6.17□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.17□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 ATRQ13535 2644 aa6.17□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 CKS1BP61024 79 aa6.16□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.16□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 X6R8D5 127 aa6.16□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 STAB1Q9NY15 2570 aa6.16□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 A0A087WZ39 114 aa6.15□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 GYPEP15421 78 aa6.15□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.15□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.15□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 CITED1Q99966 193 aa6.15□□□□□ -1.42
C4orf17-202ENST00000477187 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.15□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 CRPP02741 224 aa6.15□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.14□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.14□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 TRACP01848 142 aa6.14□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.13□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 SNCGO76070 127 aa6.13□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 C5orf38Q86SI9 138 aa6.13□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.13□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.13□□□□□ -1.43
C4orf17-202ENST00000477187 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms