RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.63□□□□□ -1.35
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ITGA6-210ENST00000475302 NOTCH1P46531 2555 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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ITGA6-210ENST00000475302 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.62□□□□□ -1.35
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ITGA6-210ENST00000475302 HERVK_113P63121 156 aa6.59□□□□□ -1.35
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ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.58□□□□□ -1.36
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ITGA6-210ENST00000475302 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.53□□□□□ -1.36
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ITGA6-210ENST00000475302 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGA6-210ENST00000475302 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.51□□□□□ -1.37
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ITGA6-210ENST00000475302 TIMM17BO60830 172 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGA6-210ENST00000475302 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ITGA6-210ENST00000475302 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.5□□□□□ -1.37
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