RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM101Q96IK0 257 aa6.79□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUPR2A6NF83 97 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TIRAPP58753 221 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LEPROTO15243 131 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HIGD1BQ9P298 99 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF815PA8K554 130 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPINK8P0C7L1 97 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GV90 55 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGLL5B9A064 214 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM262E9PQX1 116 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 J3QQQ9 107 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBX1P62877 108 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSD52Q0P140 79 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LELP1Q5T871 98 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERVK_113P63121 156 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GUV1 79 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCL18P55774 89 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H3BRM9 83 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 K7EP13 123 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEC11AP67812 179 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q6ZVH6 145 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.71□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.71□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.71□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GCSHP23434 173 aa6.71□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FXYD2P54710 66 aa6.71□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.71□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.71□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEND1Q8N111 149 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAX1BP3O14907 124 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAL2Q16559 108 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ESRGQ1W209 222 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MUC7Q8TAX7 377 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HIST1H4GQ99525 98 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0J9YXY3 114 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TM2D2Q9BX73 214 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCL25O15444 150 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SS18Q15532 418 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C5orf38Q86SI9 138 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APLNQ9ULZ1 77 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL7A1Q02388 2944 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV3-30P01768 117 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV3-33P01772 117 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XCL1P47992 114 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LITAFQ99732 161 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UPK3BQ9BT76 320 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A087WZ39 114 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NDUFA1O15239 70 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTTG1IPP53801 180 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 REG3AQ06141 175 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A6NDN8 102 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 K7ERJ3 54 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRPP02741 224 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COX7B2Q8TF08 81 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q9H8V8 135 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms