RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 SS18Q15532 418 aa9.04□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 VAMP3Q15836 100 aa9.04□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 LELP1Q5T871 98 aa9.04□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.03□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.03□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 NDUFA1O15239 70 aa9.03□□□□□ -0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.02□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0J9YWU9 116 aa9.02□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 TIMM17BO60830 172 aa9.02□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q6ZVH6 145 aa9.02□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.02□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 RAB37Q96AX2 223 aa9.02□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.01□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3-30P01768 117 aa9.01□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.01□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.01□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GWB2 263 aa9□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 H3BUT2 72 aa9□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 K7EP13 123 aa9□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 HERV-K104P63124 156 aa9□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB121Q5J5C9 76 aa9□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q6ZTC4 211 aa9□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPANXDQ9BXN6 97 aa9□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPANXCQ9NY87 97 aa9□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 K7EIL1 84 aa8.99□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 K7ERJ3 54 aa8.99□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.99□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 COPS9Q8WXC6 57 aa8.99□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.99□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A087WZ39 114 aa8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 FABP2P12104 132 aa8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE2V1Q13404 147 aa8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 SFTA2Q6UW10 78 aa8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 COX7B2Q8TF08 81 aa8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q9H8V8 135 aa8.98□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.97□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.97□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1W2PPM0 123 aa8.97□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 IFITM1P13164 125 aa8.97□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 MIAQ16674 131 aa8.97□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.97□□□□□ -0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 REG3AQ06141 175 aa8.96□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.96□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.96□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE10A6NGK3 116 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLL5B9A064 214 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 APOMO95445 188 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 XCL1P47992 114 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 LITAFQ99732 161 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.95□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 K7EP34 96 aa8.94□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRSS2P07478 247 aa8.94□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.94□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.94□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 C5orf38Q86SI9 138 aa8.94□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRAPQ8TCY5 172 aa8.94□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0B4J2C4 111 aa8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 A4D1N5 150 aa8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 COX7A2LO14548 114 aa8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRPP02741 224 aa8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.93□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.92□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 CFC1BP0CG36 223 aa8.91□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 CFC1P0CG37 223 aa8.91□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 MALP21145 153 aa8.91□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.91□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q8IZM0 81 aa8.91□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 CXCL5P42830 114 aa8.9□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.9□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 CFAP161Q6P656 301 aa8.9□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.9□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLK12Q9UKR0 248 aa8.9□□□□□ -0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.9□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.89□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.89□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 TSPAN13O95857 204 aa8.89□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3-33P01772 117 aa8.89□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRR34Q9NV39 138 aa8.89□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.88□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.88□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 NPC2P61916 151 aa8.88□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q8N3U1 123 aa8.88□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.88□□□□□ -0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERG28Q9UKR5 140 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.6 ms