RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 K7EP34 96 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 C10orf126Q8N4M7 172 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 C12orf74Q32Q52 190 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 H3BUT2 72 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 ZFAND6Q6FIF0 208 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFA12Q9UI09 145 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 MGAM2Q2M2H8 2515 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 RAB37Q96AX2 223 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0J9YXY3 114 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GUV1 79 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 K7ERJ3 54 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 VPS25Q9BRG1 176 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM1B2RUZ4 78 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 SH2D6Q7Z4S9 175 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 ICOSQ9Y6W8 199 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GWB2 263 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 A6NJY4 79 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM262E9PQX1 116 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-30P01768 117 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PPM0 123 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM238C9JI98 176 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFA1O15239 70 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXD8-201ENST00000313173 FABP2P12104 132 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 SPCS1Q9Y6A9 102 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 LITAFQ99732 161 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 LELP1Q5T871 98 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0J9YWU9 116 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 H3BNG1 76 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZTC4 211 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 TIMM17BO60830 172 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXD8-201ENST00000313173 SPANXDQ9BXN6 97 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 SPANXCQ9NY87 97 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 IGLL5B9A064 214 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 Q9H8V8 135 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 K7EIL1 84 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 SS18Q15532 418 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 MUSTN1Q8IVN3 82 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA25Q9BR10 227 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087WZ39 114 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 RPL24P83731 157 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 MIAQ16674 131 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 CLPSL2Q6UWE3 100 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf45Q8TAV5 145 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXD8-201ENST00000313173 A4D1N5 150 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 APOMO95445 188 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 LYPD5Q6UWN5 251 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00269Q8N2A0 174 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 Q8N3U1 123 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 COX7B2Q8TF08 81 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 TM2D3Q9BRN9 247 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 DNHD1Q96M86 4753 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 CFC1BP0CG36 223 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 CFC1P0CG37 223 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 ANGP03950 147 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 HERV-K104P63124 156 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 TENM3Q9P273 2699 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 XCL1P47992 114 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB121Q5J5C9 76 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 C5orf38Q86SI9 138 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 PRSS2P07478 247 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 REG3AQ06141 175 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 IFITM1P13164 125 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 LINC01561Q8N1V8 128 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 TOMM7Q9P0U1 55 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0B4J2C4 111 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN13O95857 204 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 PRO1854Q9UHT4 67 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 MEIG1Q5JSS6 88 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 CD164L2Q6UWJ8 174 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 MRAPQ8TCY5 172 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 DAND5Q8N907 189 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 NPC2P61916 151 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 F8W1H4 67 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 PRR34Q9NV39 138 aa18.27■□□□□ 0.51
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD8-201ENST00000313173 SFTA2Q6UW10 78 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00308Q8TCZ7 52 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0U1RRA0 63 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms