RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.42□□□□□ -1.06
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HDGFL3-201ENST00000299633 PRLHP81277 87 aa8.42□□□□□ -1.06
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.42□□□□□ -1.06
HDGFL3-201ENST00000299633 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.42□□□□□ -1.06
HDGFL3-201ENST00000299633 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.42□□□□□ -1.06
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HDGFL3-201ENST00000299633 C7orf33Q8WU49 177 aa8.41□□□□□ -1.06
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HDGFL3-201ENST00000299633 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.4□□□□□ -1.07
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HDGFL3-201ENST00000299633 IGKV2D-28P01615 120 aa8.39□□□□□ -1.07
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HDGFL3-201ENST00000299633 IGLV2-8P01709 118 aa8.33□□□□□ -1.08
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HDGFL3-201ENST00000299633 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HDGFL3-201ENST00000299633 MBD6Q96DN6 1003 aa8.27□□□□□ -1.08
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.27□□□□□ -1.09
HDGFL3-201ENST00000299633 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.27□□□□□ -1.09
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HDGFL3-201ENST00000299633 MUC7Q8TAX7 377 aa8.27□□□□□ -1.09
HDGFL3-201ENST00000299633 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.27□□□□□ -1.09
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