RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 MRAPQ8TCY5 172 aa10.12□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 MDFIQ99750 246 aa10.12□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 A0A1B0GUV1 79 aa10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 A6NJY4 79 aa10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 Q6ZTC4 211 aa10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 ZFAND6Q6FIF0 208 aa10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 TMEM238C9JI98 176 aa10.1□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.1□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 IGHV3-30P01768 117 aa10.09□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.09□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa10.09□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.09□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 PRSS2P07478 247 aa10.09□□□□□ -0.79
NICN1-201ENST00000273598 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.08□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 K7EIL1 84 aa10.08□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 APOMO95445 188 aa10.08□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 SS18Q15532 418 aa10.08□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 Q9H8V8 135 aa10.08□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 UBE2V1Q13404 147 aa10.07□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 C5orf38Q86SI9 138 aa10.07□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.07□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.07□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 XCL1P47992 114 aa10.07□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 LELP1Q5T871 98 aa10.07□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 Q8N3U1 123 aa10.07□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 SPATA25Q9BR10 227 aa10.07□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 NDUFA1O15239 70 aa10.06□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 MUSTN1Q8IVN3 82 aa10.06□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 CCL25O15444 150 aa10.06□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.06□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa10.05□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.05□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 A0A0U1RRA0 63 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 A0A1W2PPM0 123 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 GAGE10A6NGK3 116 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 NPC2P61916 151 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 RPL24P83731 157 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 A0A1B0GWB2 263 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 FABP2P12104 132 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 LITAFQ99732 161 aa10.04□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 A4D1N5 150 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 IGLL5B9A064 214 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 REG3AQ06141 175 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 COX7B2Q8TF08 81 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 TENM3Q9P273 2699 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 A0A087WZ39 114 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 H3BNG1 76 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 DAND5Q8N907 189 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 ANK2Q01484 3957 aa10.03□□□□□ -0.8
NICN1-201ENST00000273598 CFC1BP0CG36 223 aa10.02□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 CFC1P0CG37 223 aa10.02□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa10.02□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.02□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.02□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 MIAQ16674 131 aa10.01□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 SPANXDQ9BXN6 97 aa10.01□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 SPANXCQ9NY87 97 aa10.01□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.01□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 KLK12Q9UKR0 248 aa10.01□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 TIMM17BO60830 172 aa10□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 IGHV3-33P01772 117 aa10□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 HERV-K104P63124 156 aa10□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 SFTA2Q6UW10 78 aa9.99□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.99□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.99□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 K7EP34 96 aa9.98□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.98□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 MALP21145 153 aa9.97□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.97□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 H7C2G1 150 aa9.97□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 COX7A2LO14548 114 aa9.97□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 TSPAN13O95857 204 aa9.97□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 ESRGQ1W209 222 aa9.97□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.96□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 IFITM1P13164 125 aa9.96□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.96□□□□□ -0.81
NICN1-201ENST00000273598 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.95□□□□□ -0.82
NICN1-201ENST00000273598 CRPP02741 224 aa9.95□□□□□ -0.82
NICN1-201ENST00000273598 UBE2WQ96B02 151 aa9.95□□□□□ -0.82
NICN1-201ENST00000273598 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
NICN1-201ENST00000273598 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.95□□□□□ -0.82
NICN1-201ENST00000273598 A0A0B4J2C4 111 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms