RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav6n-5A0A075B621 112 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav6-5A0A075B6B5 112 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Csn3P06796 181 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm4894Q8CA09 118 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TdhQ8K3F7 373 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tpsg1Q9QUL7 311 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb3Q9WTL0 63 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 QrfpQ8CE23 124 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1402Q8VET1 320 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cysltr1Q99JA4 352 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem95P0DJF3 176 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm12888Q3UW77 119 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SriQ6P069 198 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ntf4Q80VU4 209 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrpl36Q99N90 102 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa8.99□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GlrxQ9QUH0 107 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm4763Q8CFJ5 196 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Psg25Q497W1 475 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cox7a2lQ61387 111 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GrhprQ91Z53 328 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LoxP28301 411 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm6871L7N248 545 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trappc1Q5NCF2 145 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AdoQ6PDY2 256 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem30bQ8BHG3 353 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lipt2Q9D009 231 aa8.98□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Umad1E0CX23 159 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm9970F6ZED4 185 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aqp7O54794 303 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defa9P50707 93 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10912Q3UXH0 145 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dock4P59764 1978 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ThadaA8C756 1938 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4931422A03RikA2BHN9 113 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Omt2bD3YX29 119 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hoxa5P09021 270 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Loxl2P58022 776 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pate4Q09098 99 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam110dQ80X91 271 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ceacam11Q9D0Z8 303 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 1700013G24RikQ9DAC6 286 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chd3B1AR17 2055 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defa37K9J724 93 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Klrd1O54707 179 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defa5P28312 93 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb18Q30KP5 85 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Reep5Q60870 185 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tusc5Q8C838 173 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp433A0A0J9YUD4 600 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm32687A0A1W2P6H7 600 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LgalslbQ7TPX9 165 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Uqcrfs1Q9CR68 274 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 2200002J24RikQ9D807 110 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam213bQ9DB60 201 aa8.97□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ColqO35348 457 aa8.96□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd69P37217 199 aa8.96□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxl7Q5BJ29 491 aa8.96□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pear1Q8VIK5 1034 aa8.96□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gata2O09100 480 aa8.96□□□□□ -0.97
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl35aO55142 110 aa8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Otx1P80205 355 aa8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zic3Q62521 466 aa8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SostQ99P68 211 aa8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr749E9Q438 313 aa8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Atp6v0e1Q9CQD8 81 aa8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10762Q9CZN6 115 aa8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr179E9PY61 2293 aa8.96□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-39A0A075B5V5 117 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PerpQ9JK95 193 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nkx2-8O70584 235 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr148Q60887 310 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Obox1Q9D350 204 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trdv1A0A075B657 112 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf48Q3US17 591 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BsxQ810B3 232 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defa13P50711 93 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf787Q8BIF9 381 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CompQ9R0G6 755 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa8.95□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm16442D3YZG3 307 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Supt4h1aP63271 117 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ApohQ01339 345 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q3UNZ8 350 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 G0s2Q61585 103 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chchd1Q9CQA6 118 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bhlha15Q9QYC3 197 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Scn8aQ9WTU3 1978 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10439A2AJU2 433 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm15114B1B0X6 433 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acrv1P50289 261 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spry4Q9WTP2 300 aa8.94□□□□□ -0.98
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm9242J3QNY1 357 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.9 ms