RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.39□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.38□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.38□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 C15orf56Q8N910 161 aa3.38□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.38□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 OCC1Q8TAD7 63 aa3.38□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 SMIM12Q96EX1 92 aa3.38□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.38□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.37□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.37□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 SLC51BQ86UW2 128 aa3.37□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 RMI2Q96E14 147 aa3.37□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 CRPP02741 224 aa3.35□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 ESDP10768 282 aa3.35□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.35□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.35□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.35□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 C9JQL5 133 aa3.34□□□□□ -1.87
HERC3-212ENST00000597259 OXTP01178 125 aa3.34□□□□□ -1.87
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HERC3-212ENST00000597259 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 LINC01551Q86U37 167 aa3.33□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.33□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 FGF6P10767 208 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 RAB4AP20338 218 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 FAM210AQ96ND0 272 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-212ENST00000597259 V9GYV3 84 aa3.32□□□□□ -1.88
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