RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592346.1

LGI4-208, Transcript of leucine rich repeat LGI family member 4, human

TSL 5

Gene LGI4, Length 557 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGI4-208	ENST00000592346	FAM104A	Q969W3	186 aa		5	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		5	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		5	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	PRR34	Q9NV39	138 aa		5	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	RTL8C	O15255	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	CRP	P02741	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	RAB5B	P61020	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	REG3A	Q06141	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346		A0A096LNJ9	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	G0S2	P27469	103 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	MIA	Q16674	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346		Q6ZUT4	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	SERF1A	O75920	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	LINC00310	P59036	64 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGI4-208	ENST00000592346	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	PSCA	O43653	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	NUPR1	O60356	82 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	HBD	P02042	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	TNP2	Q05952	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	RMI2	Q96E14	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	HSBP1	O75506	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	NPS	P0C0P6	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	AMELX	Q99217	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	VCX2	Q9H322	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	CCL25	O15444	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	XCL1	P47992	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	SS18	Q15532	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346		Q6ZN92	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346		A0A087WTM6	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346		A0A1B0GVY2	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	LECT2	O14960	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	UBE2D1	P51668	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	NDUFA6	P56556	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	FOXI1	Q12951	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	WFDC2	Q14508	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LGI4-208	ENST00000592346	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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