RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 APCP25054 2843 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TIMM17BO60830 172 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 PRM2P04554 102 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 UBE2D3P61077 147 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 UBE2D2P62837 147 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 RBX1P62877 108 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A0B4J2C4 111 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A0J9YXY3 114 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 VPREB1P12018 145 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 HERVK_113P63121 156 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6ZTI0 123 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 LY6G6DO95868 133 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6ZUT4 128 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 SPANXCQ9NY87 97 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 ITPR3Q14573 2671 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CENPEQ02224 2701 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 ZANQ9Y493 2812 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 NDUFA1O15239 70 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPAN13O95857 204 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CFC1BP0CG36 223 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CFC1P0CG37 223 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 IFITM1P13164 125 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 COPS9Q8WXC6 57 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM101Q96IK0 257 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM243Q9BU79 118 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 Q9UF83 564 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 G3V4G9 280 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 J3QR89 54 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00694P0DN24 101 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 MIAQ16674 131 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 LCE3BQ5TA77 95 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 LITAFQ99732 161 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 VPS13CQ709C8 3753 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 PDZD2O15018 2839 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE12JA6NER3 117 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 M0QXV9 152 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 UBE2L6O14933 153 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE7O76087 117 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE12FP0CL80 117 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE12GP0CL81 117 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE12IP0CL82 117 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTAP10-3P60369 221 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 HERV-K104P63124 156 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE4Q13068 117 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 GAGE5Q13069 117 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 PRO0461Q9UI25 63 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 AGRNO00468 2067 aa5.09□□□□□ -1.59
EFTUD2-208ENST00000587914 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-208ENST00000587914 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.08□□□□□ -1.6
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms