RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566497.5

MFGE8-215, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MFGE8, Length 1,689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-215ENST00000566497 PRM2P04554 102 aa11.55□□□□□ -0.56
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MFGE8-215ENST00000566497 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 STHQ8IWL8 128 aa11.55□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.55□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.55□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.55□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.55□□□□□ -0.56
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MFGE8-215ENST00000566497 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.54□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 A0A0J9YXV3 536 aa11.53□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 IGHV3-30P01768 117 aa11.53□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.53□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.53□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.52□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.56
MFGE8-215ENST00000566497 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.52□□□□□ -0.56
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MFGE8-215ENST00000566497 Q9UF83 564 aa11.51□□□□□ -0.57
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MFGE8-215ENST00000566497 NACAE9PAV3 2078 aa11.5□□□□□ -0.57
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MFGE8-215ENST00000566497 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-215ENST00000566497 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.46□□□□□ -0.57
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MFGE8-215ENST00000566497 CFC1P0CG37 223 aa11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-215ENST00000566497 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-215ENST00000566497 TIRAPP58753 221 aa11.46□□□□□ -0.57
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MFGE8-215ENST00000566497 PRO0461Q9UI25 63 aa11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-215ENST00000566497 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.46□□□□□ -0.57
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MFGE8-215ENST00000566497 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
MFGE8-215ENST00000566497 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.44□□□□□ -0.58
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MFGE8-215ENST00000566497 H3BMG7 143 aa11.44□□□□□ -0.58
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MFGE8-215ENST00000566497 APOMO95445 188 aa11.42□□□□□ -0.58
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MFGE8-215ENST00000566497 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.41□□□□□ -0.58
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MFGE8-215ENST00000566497 SPANXCQ9NY87 97 aa11.41□□□□□ -0.58
MFGE8-215ENST00000566497 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.4□□□□□ -0.58
MFGE8-215ENST00000566497 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.4□□□□□ -0.58
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MFGE8-215ENST00000566497 TIMM17BO60830 172 aa11.4□□□□□ -0.59
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MFGE8-215ENST00000566497 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.39□□□□□ -0.59
MFGE8-215ENST00000566497 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
MFGE8-215ENST00000566497 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.39□□□□□ -0.59
MFGE8-215ENST00000566497 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.39□□□□□ -0.59
MFGE8-215ENST00000566497 A8MZ25 164 aa11.38□□□□□ -0.59
MFGE8-215ENST00000566497 IGHV3-33P01772 117 aa11.38□□□□□ -0.59
MFGE8-215ENST00000566497 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.38□□□□□ -0.59
MFGE8-215ENST00000566497 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.38□□□□□ -0.59
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