RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556496.2

NRXN3-213, Transcript of neurexin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NRXN3, Length 2,737 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-213ENST00000556496 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 NOTCH2Q04721 2471 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 A0A0J9YXY3 114 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 MTURNQ8N3F0 131 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 A4D1N5 150 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 TMEM238C9JI98 176 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 G3V4G9 280 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 SPINK8P0C7L1 97 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE13Q4V321 117 aa7.56□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE12JA6NER3 117 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 A8MZ25 164 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE4Q13068 117 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE5Q13069 117 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 C16orf74Q96GX8 76 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE7O76087 117 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE12FP0CL80 117 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE12GP0CL81 117 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE12IP0CL82 117 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00694P0DN24 101 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.55□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.54□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.54□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 UBE2D3P61077 147 aa7.54□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 UBE2D2P62837 147 aa7.54□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.54□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.54□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 PSMB2P49721 201 aa7.53□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP10-3P60369 221 aa7.53□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 ETDBQ3ZM63 59 aa7.53□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 PRO0461Q9UI25 63 aa7.53□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.53□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 PF4P02776 101 aa7.53□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.53□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
NRXN3-213ENST00000556496 PRSS2P07478 247 aa7.52□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 LITAFQ99732 161 aa7.52□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 LY6G6DO95868 133 aa7.52□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TIRAPP58753 221 aa7.52□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.52□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 COX6A2Q02221 97 aa7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 H7C2G1 150 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 HERVK_113P63121 156 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TMEM101Q96IK0 257 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 A0A0B4J2C4 111 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TCL1BO95988 128 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 IGHV3-33P01772 117 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 ERG28Q9UKR5 140 aa7.5□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TMEM243Q9BU79 118 aa7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 UBE2L6O14933 153 aa7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 NPC2P61916 151 aa7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 SPANXCQ9NY87 97 aa7.49□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.48□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 MIAQ16674 131 aa7.48□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 Q1RN00 199 aa7.48□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 J3QR89 54 aa7.48□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 CIDEAO60543 219 aa7.48□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 NDUFA1O15239 70 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 FHL2Q14192 279 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 INAFM1C9JVW0 142 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 CRLF1O75462 422 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 DEFB130BP0DP73 79 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 DEFB130AP0DP74 79 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 DAND5Q8N907 189 aa7.47□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.46□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 INSL3P51460 131 aa7.46□□□□□ -1.21
NRXN3-213ENST00000556496 Q9H8V8 135 aa7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms