RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533541.1

SLC8A3-208, Transcript of solute carrier family 8 member A3, human

TSL 2 BASIC

Gene SLC8A3, Length 3,409 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC8A3-208	ENST00000533541	GAGE5	Q13069	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	GAGE6	Q13070	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	STH	Q8IWL8	128 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	TRIAP1	O43715	76 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	PLA2G2A	P14555	144 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	ODF3	Q96PU9	254 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	IFITM1	P13164	125 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	FHL3	Q13643	280 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	CCL24	O00175	119 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	DAND5	Q8N907	189 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	PROK1	P58294	105 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	ZNF415	Q09FC8	603 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	TENM4	Q6N022	2769 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541		A8MZ25	164 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	IGHV3-53	P01767	116 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	BRI3	O95415	125 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	AMELX	Q99217	191 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	ESM1	Q9NQ30	184 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	TMEM89	A2RUT3	159 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	GAGE7	O76087	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	PF4	P02776	101 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	GAGE12F	P0CL80	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	GAGE12G	P0CL81	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	GAGE12I	P0CL82	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	GAGE4	Q13068	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SLC8A3-208	ENST00000533541	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	MIA	Q16674	131 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	CR1	P17927	2039 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	ATR	Q13535	2644 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	CITED1	Q99966	193 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541		H3BT86	120 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541		Q9H8V8	135 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	LINC01006	Q8NI28	216 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	FSHB	P01225	129 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	CRLF1	O75462	422 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541		H7C423	109 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541		M0QXV9	152 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	UBE2L6	O14933	153 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	INS	P01308	110 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	HERVK_113	P63121	156 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	F8	P00451	2351 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	INAFM1	C9JVW0	142 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	LST1	O00453	97 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541		Q9UF83	564 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	DNAL4	O96015	105 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SLC8A3-208	ENST00000533541	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5

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