RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 F8P00451 2351 aa5.76□□□□□ -1.49
USP54-210ENST00000466048 PSCAO43653 123 aa5.76□□□□□ -1.49
USP54-210ENST00000466048 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.76□□□□□ -1.49
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USP54-210ENST00000466048 CLEC2BQ92478 149 aa5.7□□□□□ -1.5
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USP54-210ENST00000466048 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.69□□□□□ -1.5
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USP54-210ENST00000466048 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.69□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 LECT2O14960 151 aa5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 TIMM17BO60830 172 aa5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 UPK3BQ9BT76 320 aa5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 USP24Q9UPU5 2620 aa5.68□□□□□ -1.5
USP54-210ENST00000466048 USP17L23D6RBM5 183 aa5.68□□□□□ -1.5
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