RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 SPATA12Q7Z6I5 190 aa16.57■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 Q8N976 141 aa16.57■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 PRSS1P07477 247 aa16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 AKR1D1P51857 326 aa16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 CCL18P55774 89 aa16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 A0A1B0GUV1 79 aa16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 NPSP0C0P6 89 aa16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 RBX1P62877 108 aa16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 OR5A1Q8NGJ0 315 aa16.56■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 TCTAP57738 103 aa16.55■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa16.55■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 LYSTQ99698 3801 aa16.54■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 TMEM101Q96IK0 257 aa16.54■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.53■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 AMELXQ99217 191 aa16.53■□□□□ 0.24
NME4-209ENST00000460297 A0A087WX48 190 aa16.52■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 PET117Q6UWS5 81 aa16.52■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 VCX2Q9H322 139 aa16.52■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 CST9LQ9H4G1 147 aa16.52■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 PRSS29PA6NIE9 313 aa16.51■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 PMVKQ15126 192 aa16.51■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa16.51■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 PKIAP61925 76 aa16.5■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa16.5■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 ODF1Q14990 250 aa16.5■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 TEX43Q6ZNM6 134 aa16.5■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 PMCHL2Q9BQD1 86 aa16.5■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 LINC01545Q5VT33 79 aa16.49■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 UPK3BQ9BT76 320 aa16.49■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 IGHV3-30P01768 117 aa16.48■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 IGHV3-33P01772 117 aa16.48■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa16.48■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa16.48■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 PYY3Q5JQD4 70 aa16.47■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.47■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 SCGB1D1O95968 90 aa16.46■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 ANGP03950 147 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 DNAH10OSP0CZ25 163 aa16.46■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 LINC01556Q5JQF7 62 aa16.46■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NME4-209ENST00000460297 SIVA1O15304 175 aa16.45■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 CASC10Q5T4H9 136 aa16.44■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 LINC00269Q8N2A0 174 aa16.44■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa16.43■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 C2orf88Q9BSF0 95 aa16.43■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 KLK12Q9UKR0 248 aa16.43■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa16.43■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 F8VRH5 84 aa16.43■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 CLPSL2Q6UWE3 100 aa16.43■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 DNAH1Q9P2D7 4330 aa16.42■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.42■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa16.42■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 C20orf202A1L168 122 aa16.42■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 UBE2D1P51668 147 aa16.42■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 Q9H8V8 135 aa16.42■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 A0A0J9YXV3 536 aa16.4■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 C3orf84H3BNL1 204 aa16.4■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 REG3AQ06141 175 aa16.4■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 PRR34Q9NV39 138 aa16.4■□□□□ 0.22
NME4-209ENST00000460297 VPS13DQ5THJ4 4388 aa16.39■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 ATOH7Q8N100 152 aa16.39■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa16.38■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 CDPF1Q6NVV7 123 aa16.38■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 DPM2O94777 84 aa16.37■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 ENHOQ6UWT2 76 aa16.37■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 C11orf86A6NJI1 115 aa16.37■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 IGLC3P0DOY3 106 aa16.37■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 LINC00242Q5T6M2 205 aa16.37■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 IGKCP01834 107 aa16.36■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa16.36■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 NFE4Q86UQ8 179 aa16.36■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 PLNP26678 52 aa16.35■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.35■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa16.34■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 COX6A2Q02221 97 aa16.34■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 UBE2WQ96B02 151 aa16.34■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 SMIM6P0DI80 62 aa16.34■□□□□ 0.21
NME4-209ENST00000460297 CRPP02741 224 aa16.32■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.31■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 SS18Q15532 418 aa16.31■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 CCL25O15444 150 aa16.3■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 MAJINQ3KP22 176 aa16.3■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa16.3■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa16.3■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 SEC11AP67812 179 aa16.3■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 HERVK_113P63121 156 aa16.29■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 C10orf126Q8N4M7 172 aa16.29■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa16.28■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa16.28■□□□□ 0.2
NME4-209ENST00000460297 hDV102S1A0JD36 115 aa16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms