RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.55□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.55□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8N976 141 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRSS1P07477 247 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZUT4 128 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAALCQ8WXS3 180 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM104AQ969W3 186 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 VCX2Q9H322 139 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q9H8V8 135 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7EP13 123 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMELXQ99217 191 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-30P01768 117 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-33P01772 117 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMVKQ15126 192 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf79P0CE67 100 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTDAPP60985 99 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q8N3U1 123 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf88Q9BSF0 95 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CST9LQ9H4G1 147 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PET117Q6UWS5 81 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 TGP01266 2768 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK12Q9UKR0 248 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 H0Y8G0 127 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 REG3AQ06141 175 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR34Q9NV39 138 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSMD3Q7Z407 3707 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL25O15444 150 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 C20orf202A1L168 122 aa11.46□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRPP02741 224 aa11.46□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.46□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2D1P51668 147 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ODF1Q14990 250 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC32Q5I0X7 151 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01545Q5VT33 79 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 F8VRH5 84 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKR1D1P51857 326 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC11AP67812 179 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIAQ16674 131 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENHOQ6UWT2 76 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.43□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.43□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SS18Q15532 418 aa11.43□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.43□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.43□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2WQ96B02 151 aa11.43□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLNP26678 52 aa11.42□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 LY6G6CO95867 125 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLC3P0DOY3 106 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0J9YXV3 536 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPM2O94777 84 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 HERVK_113P63121 156 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFE4Q86UQ8 179 aa11.41□□□□□ -0.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCGB1D1O95968 90 aa11.4□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.4□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKCP01834 107 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.39□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 RMI2Q96E14 147 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.38□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf86A6NJI1 115 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 XCL1P47992 114 aa11.37□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.36□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q9HAA7 133 aa11.36□□□□□ -0.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 COX11Q9Y6N1 276 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms