RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 SPINK13Q1W4C9 94 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2E2Q96LR5 201 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BT86 120 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV2D-28P01615 120 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL11P62913 178 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB112Q30KQ8 113 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SCGB2A1O75556 95 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 KRTAP1-1Q07627 177 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SPINK8P0C7L1 97 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 I3L3M4 83 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LY6DQ14210 128 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM101Q96IK0 257 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 RS1O15537 224 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFA1O15239 70 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFA7O95182 113 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 COX6A2Q02221 97 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 RAX2Q96IS3 184 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 A6NJY4 79 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 NRGNQ92686 78 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MWV9 139 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 PF4V1P10720 104 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 KRTAP10-9P60411 292 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNJ2BPP57105 145 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01587Q99440 93 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GV72 72 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 J3QR89 54 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 IFITM1P13164 125 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6YL49 198 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf38Q86SI9 138 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8NDZ9 215 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf48Q96LS8 159 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LY6EQ16553 131 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 B4DSR2 109 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CKS1BP61024 79 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 MGPP08493 103 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CD28P10747 220 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 GNLYP22749 145 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 C9JAW5 83 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM262E9PQX1 116 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf82Q6UX34 121 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 PIMREGQ9BSJ6 248 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 VPREB3Q9UKI3 123 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 ICOSQ9Y6W8 199 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRGV11A0A075B6L2 103 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 KNCNA6PVL3 124 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC179H3BU77 68 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 LY6G6DO95868 133 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 DAND5Q8N907 189 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC2BQ92478 149 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 SPXQ9BT56 116 aa2.53□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB136Q30KP8 78 aa2.53□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0087Q14695 138 aa2.53□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 TRACP01848 142 aa2.53□□□□□ -2
PGGT1B-203ENST00000419445 COX7A2LO14548 114 aa2.53□□□□□ -2.01
PGGT1B-203ENST00000419445 SLURP1P55000 103 aa2.53□□□□□ -2.01
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.52□□□□□ -2.01
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMB2P49721 201 aa2.52□□□□□ -2.01
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.52□□□□□ -2.01
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.52□□□□□ -2.01
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