RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 IGIPA6NJ69 53 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 KLK12Q9UKR0 248 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 J3QLI3 93 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 MIFP14174 115 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 RMI2Q96E14 147 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 SORL1Q92673 2214 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 A6NED7 52 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 H0Y9J4 135 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 CCKP06307 115 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 C3orf84H3BNL1 204 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 K7ENP7 123 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 EML5Q05BV3 1969 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 DCANP1Q8TF63 244 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 ODF3Q96PU9 254 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 ODF3BA8MYP8 253 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZQY7 126 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 Q96MF0 132 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 DEFB4AO15263 64 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 K7EQG2 157 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 SEC61GP60059 68 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 PMAIP1Q13794 54 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 ZNF580Q9UK33 172 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 AGRNO00468 2067 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 IGKV4-1P06312 121 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 RETNQ9HD89 108 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 CRYGDP07320 174 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 TECTAO75443 2155 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 LY6LH3BQJ8 138 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 REG3AQ06141 175 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 PRO0461Q9UI25 63 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 PRO0255Q9UI72 69 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 CCL18P55774 89 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 CELA1Q9UNI1 258 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 A0A0J9YWU9 116 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WYN8 130 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 PRO0628Q9UI54 55 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 A6NDX4 124 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 PTPN13Q12923 2485 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 EBI3Q14213 229 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 C4orf26Q17RF5 130 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 KLLNB2CW77 178 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 PRM2P04554 102 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 K7ERS5 55 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 C9orf85Q96MD7 179 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 TMEM89A2RUT3 159 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 UBE2AP49459 152 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 DEFB135Q30KP9 77 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 PSPHP1O15172 72 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 HILS1P60008 231 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 LINC00846Q9NV44 126 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 LYRM9A8MSI8 78 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 A0A096LNI7 61 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 FSTL3O95633 263 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 Q8N3U1 123 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 PRYO14603 147 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-202ENST00000402738 PIP4P1Q86T03 277 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms