RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 RNF152Q8N8N0 203 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 VCYO14598 125 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 NPC2P61916 151 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 C4orf26Q17RF5 130 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 PRSS2P07478 247 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 IMUPQ9GZP8 106 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 OXTP01178 125 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 HTN1P15515 57 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 APCP25054 2843 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 DEFB136Q30KP8 78 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 C2orf48Q96LS8 159 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 COX7CP15954 63 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 ZNF876PQ49A33 203 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 F5H768 121 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 SLURP1P55000 103 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 M0QY20 66 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 Q8N2B8 174 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS6-201ENST00000299238 LST1O00453 97 aa14.71□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 PRM2P04554 102 aa14.71□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 TIMM17AQ99595 171 aa14.71□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 TMEM141Q96I45 108 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 NF1P21359 2839 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 A0A0J9YXY3 114 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 LEPROTO15243 131 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 RPS28P62857 69 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 I3L3M4 83 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 CHD6Q8TD26 2715 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 DSCR8Q96T75 97 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 CRYGAP11844 174 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 COX6CP09669 75 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 ITPR3Q14573 2671 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 KNCNA6PVL3 124 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 RHOHQ15669 191 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 LINC00643Q86TS7 51 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 DPH3Q96FX2 82 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 LITAFQ99732 161 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 AKAP9Q99996 3911 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 RS1O15537 224 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS6-201ENST00000299238 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.64□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 PROK1P58294 105 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 A0A0J9YXV3 536 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 C5orf38Q86SI9 138 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 NACAE9PAV3 2078 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 TRACP01848 142 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 ACYP1P07311 99 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 DEFB131AP59861 70 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 Q5XG85 94 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 PEMTQ9UBM1 199 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 A8MTW9 85 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 Q9UF83 564 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 TENM4Q6N022 2769 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 ATP5G1P05496 136 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 A8MZ25 164 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 TMEM86BQ8N661 226 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 DAND5Q8N907 189 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS6-201ENST00000299238 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.56□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HPS6-201ENST00000299238 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms