RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023154.2

Cldn1-201, Transcript of Claudin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn1, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn1-201ENSMUST00000023154 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sumo1P63166 101 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm4792Q569Q2 183 aa7.28□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cd200r3Q5UKY4 296 aa7.28□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 FshbQ60687 130 aa7.28□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr147Q60886 317 aa7.28□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 2810408A11RikQ6NSU2 435 aa7.28□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 9230109A22RikQ8BHE6 111 aa7.28□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vmn1r70Q8R254 298 aa7.28□□□□□ -1.24
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ovol1Q9WTJ2 267 aa7.28□□□□□ -1.24
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm9945Q8BNZ3 91 aa7.27□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1258Q8VGN6 311 aa7.27□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cma2Q91VB1 246 aa7.27□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Parm1Q923D3 296 aa7.27□□□□□ -1.24
Cldn1-201ENSMUST00000023154 SmagpQ99KC7 97 aa7.27□□□□□ -1.24
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Osr1Q9WVG7 266 aa7.27□□□□□ -1.24
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vmn1r78K7N608 313 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ccl1P10146 92 aa7.27□□□□□ -1.25
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Smim9Q3V0X1 137 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Repin1Q5U4E2 545 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Megf9Q8BH27 600 aa7.27□□□□□ -1.25
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Oxld1Q9CR10 201 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gpr35Q9ES90 307 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pus1Q9WU56 423 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Opn3Q9WUK7 400 aa7.27□□□□□ -1.25
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm37388A0A0A6YY46 143 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P01915 264 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ptbp1P17225 527 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pla2g2aP31482 146 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1535Q7TQU0 326 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ifna14Q810G3 189 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Foxj2Q9ES18 565 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cbln1Q9R171 193 aa7.27□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm15292L7N231 93 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fgfbp1O70514 251 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Defa26Q3L180 93 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Smim7Q5RKS2 75 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 GaptQ8CB93 157 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mpv17lQ99MS3 194 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fkbp11Q9D1M7 201 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ighv7-3A0A075B5R2 120 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ighv5-8A0A075B676 92 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm10203F6QJ09 66 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gstp1P19157 210 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vamp3P63024 103 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr963Q7TRA9 311 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MmdQ9CQY7 238 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ndufb3Q9CQZ6 104 aa7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ammecr1Q9JHT5 344 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ighv1-39A0A075B5V5 117 aa7.25□□□□□ -1.25
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gpm6bP35803 328 aa7.25□□□□□ -1.25
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Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc36a4Q8CH36 500 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ido2Q8R0V5 405 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1242Q8VGM6 306 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Errfi1Q99JZ7 461 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nicn1Q9CQM0 213 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q9DAZ5 108 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zdhhc16Q9ESG8 361 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PigpQ9JHG1 132 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cml1Q9JIZ0 222 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ArtnQ9Z0L2 224 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cep250Q60952 2414 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Trbv31A0A075B5J5 111 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Prss32E9Q409 334 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm12169F2Z474 250 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tcf21O35437 179 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rnf5O35445 180 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P01792 123 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Higd1cQ76I25 96 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Prss3Q792Z0 246 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr262Q8VFV8 312 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rab4bQ91ZR1 213 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gng10Q9CXP8 68 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 TecrQ9CY27 308 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Kcnmb2Q9CZM9 235 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rnase4Q9JJH1 148 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ighv14-2A0A075B5R7 117 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zfp980A2A9J5 645 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm14325A2AW67 498 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Casp6O08738 276 aa7.25□□□□□ -1.25
Cldn1-201ENSMUST00000023154 P03980 138 aa7.25□□□□□ -1.25
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