Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Gata4Q08369 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Gata4Q08369 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Gata4Q08369 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Gata4Q08369 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Gata4Q08369 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Gata4Q08369 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Gata4Q08369 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,14■■□□□ 1,78
Gata4Q08369 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Gata4Q08369 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Gata4Q08369 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gata4Q08369 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Gata4Q08369 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gata4Q08369 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Gata4Q08369 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gata4Q08369 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gata4Q08369 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Gata4Q08369 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Gata4Q08369 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gata4Q08369 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gata4Q08369 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gata4Q08369 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Gata4Q08369 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Gata4Q08369 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Gata4Q08369 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Gata4Q08369 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Gata4Q08369 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Gata4Q08369 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Gata4Q08369 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Gata4Q08369 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Gata4Q08369 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gata4Q08369 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Gata4Q08369 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gata4Q08369 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Gata4Q08369 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Gata4Q08369 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Gata4Q08369 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gata4Q08369 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Gata4Q08369 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gata4Q08369 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Gata4Q08369 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Gata4Q08369 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Gata4Q08369 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Gata4Q08369 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
Gata4Q08369 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Gata4Q08369 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Gata4Q08369 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Gata4Q08369 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Gata4Q08369 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Gata4Q08369 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Gata4Q08369 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Gata4Q08369 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Gata4Q08369 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Gata4Q08369 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Gata4Q08369 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,34
Gata4Q08369 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Gata4Q08369 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Gata4Q08369 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
Gata4Q08369 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Gata4Q08369 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Gata4Q08369 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
Gata4Q08369 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gata4Q08369 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Gata4Q08369 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Gata4Q08369 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gata4Q08369 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Gata4Q08369 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Gata4Q08369 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Gata4Q08369 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Gata4Q08369 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gata4Q08369 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Gata4Q08369 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Gata4Q08369 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Gata4Q08369 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Gata4Q08369 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Gata4Q08369 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
Gata4Q08369 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Gata4Q08369 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Gata4Q08369 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Gata4Q08369 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Gata4Q08369 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Gata4Q08369 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
Gata4Q08369 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Gata4Q08369 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Gata4Q08369 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
Gata4Q08369 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Gata4Q08369 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,63■■□□□ 1,21
Gata4Q08369 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Gata4Q08369 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Gata4Q08369 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Gata4Q08369 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Gata4Q08369 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Gata4Q08369 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,47■■□□□ 1,19
Gata4Q08369 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
Gata4Q08369 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Gata4Q08369 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Gata4Q08369 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Gata4Q08369 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
Gata4Q08369 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Gata4Q08369 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms