Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Gata4Q08369 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gata4Q08369 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gata4Q08369 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gata4Q08369 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gata4Q08369 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gata4Q08369 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gata4Q08369 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gata4Q08369 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gata4Q08369 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gata4Q08369 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gata4Q08369 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gata4Q08369 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gata4Q08369 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gata4Q08369 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gata4Q08369 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gata4Q08369 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gata4Q08369 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gata4Q08369 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gata4Q08369 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gata4Q08369 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gata4Q08369 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gata4Q08369 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gata4Q08369 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gata4Q08369 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gata4Q08369 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gata4Q08369 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gata4Q08369 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gata4Q08369 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gata4Q08369 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gata4Q08369 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gata4Q08369 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gata4Q08369 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gata4Q08369 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gata4Q08369 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gata4Q08369 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gata4Q08369 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gata4Q08369 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gata4Q08369 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gata4Q08369 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gata4Q08369 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gata4Q08369 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gata4Q08369 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gata4Q08369 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gata4Q08369 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gata4Q08369 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata4Q08369 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gata4Q08369 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gata4Q08369 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gata4Q08369 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata4Q08369 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gata4Q08369 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gata4Q08369 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gata4Q08369 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gata4Q08369 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gata4Q08369 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gata4Q08369 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gata4Q08369 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gata4Q08369 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gata4Q08369 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gata4Q08369 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gata4Q08369 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gata4Q08369 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gata4Q08369 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gata4Q08369 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gata4Q08369 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gata4Q08369 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gata4Q08369 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gata4Q08369 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata4Q08369 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gata4Q08369 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gata4Q08369 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gata4Q08369 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gata4Q08369 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata4Q08369 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata4Q08369 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gata4Q08369 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gata4Q08369 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata4Q08369 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata4Q08369 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata4Q08369 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata4Q08369 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gata4Q08369 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata4Q08369 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata4Q08369 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gata4Q08369 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata4Q08369 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gata4Q08369 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gata4Q08369 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata4Q08369 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gata4Q08369 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gata4Q08369 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gata4Q08369 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gata4Q08369 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gata4Q08369 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gata4Q08369 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gata4Q08369 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gata4Q08369 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gata4Q08369 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gata4Q08369 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms