RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YBR259WP38338 688 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W HMF1P40037 129 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W UBP7P40453 1071 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YRB1P41920 201 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W EMC2P47133 292 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RFX1P48743 811 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W CUL3P53202 744 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YNL146WP53906 100 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YMR209CQ03648 457 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YML037CQ03703 340 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W TAF11Q04226 346 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W AIM39Q08223 395 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YLL056CQ12177 298 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W PCD1Q12524 340 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RGS2Q99188 309 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W DED1P06634 604 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W SAM1P10659 382 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RPN2P32565 945 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W IES5P40060 125 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YIL054WP40524 105 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RRN7P40992 514 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W DAN4P47179 1161 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W HST2P53686 357 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W MUB1Q03162 620 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YDR239CQ03780 787 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RSM24Q03976 319 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W FMP42Q04991 504 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W COQ9Q05779 260 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W CIR2Q08822 631 aa10.51□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W GSC2P40989 1895 aa10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W CAR1P00812 333 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RDH54P38086 958 aa10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W DSF2P38213 736 aa10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W ACA1P39970 489 aa10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W GTT3P39996 337 aa10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W IRR1P40541 1150 aa10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YDR090CQ03193 310 aa10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YRR1Q12172 810 aa10.5□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W VMA2P16140 517 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W TSR4P25040 408 aa10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W MET4P32389 672 aa10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W PHA2P32452 334 aa10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RPT5P33297 434 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W MCR1P36060 302 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YMC2P38087 329 aa10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W OTU2P38747 307 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W ETP1P38748 585 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W SHU2P38957 223 aa10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W ORM1P53224 222 aa10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YPR003CP53394 754 aa10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W HRR25P29295 494 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W TVP38P36164 337 aa10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W ZAP1P47043 880 aa10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W NMA111P53920 997 aa10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W SMP3Q04174 516 aa10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W NTO1Q12311 748 aa10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W NHA1Q99271 985 aa10.48□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data10.47□□□□□ -0.73not detected
PRP4YPR178W VAC17P25591 423 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W CCR4P31384 837 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RPC82P32349 654 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RIM1P32445 135 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W APN2P38207 520 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W CRP1P38845 465 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W SHC1P39000 512 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W HPM1P40481 377 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W MND2P40577 368 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YFR006WP43590 535 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W VTC4P47075 721 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W MND1P53102 219 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W DYN3Q04949 312 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W FAR10Q06001 478 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YDL114WQ07530 308 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W APC9Q12107 265 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YOR342CQ12182 319 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W EMP46Q12396 444 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W VPS5Q92331 675 aa10.47□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W STE2D6VTK4 431 aa10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W GAL10P04397 699 aa10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W COR1P07256 457 aa10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W YPK1P12688 680 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W DPH2P32461 534 aa10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W TPO5P36029 618 aa10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W YBR138CP38277 524 aa10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W GOS1P38736 223 aa10.46□□□□□ -0.74
PRP4YPR178W PEX18P38855 283 aa10.46□□□□□ -0.74
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