RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A IES1P43579 692 aa3.34□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A RET2P43621 546 aa3.34□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A NTG2Q08214 380 aa3.34□□□□□ -1.87
YHL009W-AYHL009W-A FTH1P38310 465 aa3.33□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A MET30P39014 640 aa3.33□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A YLR001CQ07895 862 aa3.33□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A GAL4P04386 881 aa3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A ILS1P09436 1072 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A VPS33P20795 691 aa3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A MAK32P23060 363 aa3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A YOX1P34161 385 aa3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A CIN1P40987 1014 aa3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A YDL183CP48569 320 aa3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A ORC1P54784 914 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A RAD33Q04231 177 aa3.32□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A BET2P20133 325 aa3.31□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A SEC65P29478 273 aa3.31□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A MTC7P32633 139 aa3.31□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A YIL169CP40442 995 aa3.31□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A YMR317WQ04893 1140 aa3.31□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A CRT10Q08226 957 aa3.31□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A SLX1P38324 304 aa3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A TOM71P38825 639 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A VRG4P40107 337 aa3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A SAD1P43589 448 aa3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A YNL193WP53870 558 aa3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A VTC3Q02725 835 aa3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A RTT103Q05543 409 aa3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A SKP2P42843 763 aa3.29□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A MLH2Q07980 695 aa3.29□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A YOR389WQ08912 624 aa3.29□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A PCK1P10963 549 aa3.28□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A HMG2P12684 1045 aa3.28□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A GDA1P32621 518 aa3.28□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A CIR1P42940 261 aa3.28□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A TFB2Q02939 513 aa3.28□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A POB3Q04636 552 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YHL009W-AYHL009W-A DSS4P32601 143 aa3.27□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YBR139WP38109 508 aa3.27□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A CKB2P38930 258 aa3.27□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YNL092WP53934 400 aa3.27□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A PFA4Q12006 378 aa3.27□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.27□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A CDC5P32562 705 aa3.26□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A MGS1P40151 587 aa3.26□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A VID28P40547 921 aa3.26□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.25□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A RAD26P40352 1085 aa3.25□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YGR153WP48238 217 aa3.25□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YPT11P48559 417 aa3.25□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YTA7P40340 1379 aa3.25□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A RTC1Q08281 1341 aa3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A SEC12P11655 471 aa3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A PPZ1P26570 692 aa3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A HXT7P39004 570 aa3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A LAS21P40367 830 aa3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A COG2P53271 262 aa3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A SDA1P53313 767 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A RNH70P53331 553 aa3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A RRI1Q12468 440 aa3.24□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A CDC26P14724 124 aa3.23□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A DGR2P32330 852 aa3.23□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A SFP1P32432 683 aa3.23□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YJR096WP47137 282 aa3.23□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A ALG12P53730 551 aa3.23□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A DNM1P54861 757 aa3.23□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YHM2Q04013 314 aa3.23□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YFL068WP0CX99 160 aa3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YLL066W-AP0CY00 160 aa3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YLL067W-AP0CY01 160 aa3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A CNA1P23287 553 aa3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A OAF3P36023 863 aa3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A FAT1P38225 669 aa3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A YNL144CP53907 740 aa3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
YHL009W-AYHL009W-A RRP43P25359 394 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A KES1P35844 434 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A SDH8P38345 138 aa3.21□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A OSW7P43611 510 aa3.21□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A ECM9Q02202 377 aa3.21□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A GSH2Q08220 491 aa3.21□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A LYS21Q12122 440 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A NOP2P40991 618 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.8 ms