RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W APM3P38153 483 aa9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W SRP68P38687 599 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W TDA3P38758 523 aa9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W COG7P53195 279 aa9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W NRM1P53718 249 aa9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W ORC3P54790 616 aa9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W PEX11Q12462 236 aa9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W AIM44Q99299 758 aa9.29□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W SST2P11972 698 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W YPK1P12688 680 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W TEC1P18412 486 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W MIH1P23748 554 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W PMT1P33775 817 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W FUI1P38196 639 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W SPT8P38915 602 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W EMW1P42842 904 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W EMC4P53073 190 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W SNO2P53823 222 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W INP2Q03824 705 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W GRX8Q05926 109 aa9.28□□□□□ -0.92
CPD1YGR247W SPT15P13393 240 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W POL30P15873 258 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RDS2P19541 446 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W ADY2P25613 283 aa9.27□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W KAR9P32526 644 aa9.27□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RKM2Q03942 479 aa9.27□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W SFI1Q12369 946 aa9.27□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YEL077CQ3E7X8 1277 aa9.27□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W SUC2P00724 532 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W GAL4P04386 881 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W BRF1P29056 596 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W TGL4P36165 910 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W MUM2P38236 366 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RRP3P38712 501 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YIL054WP40524 105 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W HXT8P40886 569 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W INA17Q02888 182 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RTT10Q08924 1013 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W THI21Q08975 551 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W SRO7Q12038 1033 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W GNT1Q12096 491 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RKM5Q12367 367 aa9.26□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W MRPL8P22353 238 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RRN6P32786 894 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W TAE1P38340 232 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W GLG2P47011 380 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W MNT2P53059 558 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YNL108CP53929 270 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YML096WQ04489 525 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YDR222WQ04925 415 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W BNA5Q05979 453 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W THI73Q07904 523 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W TMA16Q08687 178 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa9.25□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W MTF2P10849 440 aa9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W CIN8P27895 1000 aa9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W SPC110P32380 944 aa9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W PSY4P38193 441 aa9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W SWC5P38326 303 aa9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RAD26P40352 1085 aa9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YJR124CP47159 448 aa9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W ERV41Q04651 352 aa9.24□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W TUP1P16649 713 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W STE4P18851 423 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W MNE1P24720 663 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W SLD2P34252 453 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W UBP14P38237 781 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W RRN7P40992 514 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W TAD1P53065 400 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YGR111WP53265 400 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W BET4Q00618 327 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YPR114WQ06107 315 aa9.23□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W SBP1P10080 294 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W PPE1P38796 400 aa9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W TMN3P40071 706 aa9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W DLD2P46681 530 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W CIS3P47001 227 aa9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.22□□□□□ -0.93not detected
CPD1YGR247W ASN2P49090 572 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W MTO1P53070 669 aa9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W IPI3P53877 555 aa9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W HAP5Q02516 242 aa9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W PPN1Q04119 674 aa9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W ATG10Q07879 167 aa9.22□□□□□ -0.93
CPD1YGR247W LEU1P07264 779 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CPD1YGR247W RIP1P08067 215 aa9.21□□□□□ -0.94
CPD1YGR247W PRP9P19736 530 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CPD1YGR247W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CPD1YGR247W YEL028WP39989 153 aa9.21□□□□□ -0.94
CPD1YGR247W MMM1P41800 426 aa9.21□□□□□ -0.94
CPD1YGR247W YJL132WP47014 750 aa9.21□□□□□ -0.94
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