RNA–Protein interactions for RNA: YGL058W

RAD6, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme (E2), yeast

Gene RAD6, Length 519 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD6	YGL058W	SIR1	P21691	654 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	SDH8	P38345	138 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	YHL041W	P38730	149 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	POL31	P46957	487 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	SAP4	P53036	818 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	COS12	P53053	380 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	YGL117W	P53133	265 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	CPR8	P53728	308 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	CRD1	Q07560	283 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RAD6	YGL058W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	STE12	P13574	688 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YCR061W	P25639	631 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YPT10	P38146	199 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	APM3	P38153	483 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PIH1	P38768	344 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	SPC72	P39723	622 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	VFA1	P40080	203 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
RAD6	YGL058W	TGS1	Q12052	315 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	WHI2	P12611	486 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	BET2	P20133	325 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	SPO11	P23179	398 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	CDC5	P32562	705 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PAC2	P39937	518 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	COQ6	P53318	479 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YNL092W	P53934	400 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ACS1	Q01574	713 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ARG7	Q04728	441 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	BNR1	P40450	1375 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	AAC1	P04710	309 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PMA2	P19657	947 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PEX2	P32800	271 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ACA1	P39970	489 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	IES5	P40060	125 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	IDS2	P46958	469 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	VPS64	Q03944	604 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	HIM1	Q06674	414 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	AIM6	Q07716	390 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	CRT10	Q08226	957 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PCL8	Q08966	492 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ULA1	Q12059	462 aa		3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PHO81	P17442	1178 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	MDM10	P18409	493 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	RIT1	P23796	513 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	MSH1	P25846	959 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YMC1	P32331	307 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PPZ2	P33329	710 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	FLO10	P36170	1169 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	IMA1	P53051	589 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	CIA1	Q05583	330 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ARO10	Q06408	635 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	CTT1	P06115	562 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	BIK1	P11709	440 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	POL3	P15436	1097 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	MSM1	P22438	575 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	FUI1	P38196	639 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YBR138C	P38277	524 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YFL015C	P43578	164 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	AFT2	Q08957	416 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	AMD2	P22580	549 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	YCL049C	P25577	312 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	AAD3	P25612	363 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	GDA1	P32621	518 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RAD6	YGL058W	PUG1	P40100	303 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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