RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RAD16	P31244	790 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RPC37	P36121	282 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	PIM1	P36775	1133 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	YHL041W	P38730	149 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	VPS41	P38959	992 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	PXA1	P41909	870 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SPO1	P53541	631 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	YFT2	Q06676	274 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SWA2	Q06677	668 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	TAF3	Q12297	353 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	STF1	P01098	86 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	KCC4	P25389	1037 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	DAL80	P26343	269 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	UBS1	P38290	277 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	ACA1	P39970	489 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	YIL077C	P40508	320 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	VID28	P40547	921 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	STU2	P46675	888 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	NIT2	P47016	307 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RFX1	P48743	811 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	ZDS2	P54786	942 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	TIM50	Q02776	476 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	YLR287C	Q05881	355 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.12	□□□□□ -1.59	not detected
ACT1	YFL039C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SMC6	Q12749	1114 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SPO16	P17122	198 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	PHO81	P17442	1178 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	PET123	P17558	318 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RER1	P25560	188 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	POL4	P25615	582 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	CNS1	P33313	385 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SET3	P36124	751 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	COS111	P38308	924 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	DUN1	P39009	513 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	MPS3	P47069	682 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	TAF4	P50105	388 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	MEP3	P53390	489 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SKY1	Q03656	742 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	USV1	Q12132	391 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.11	□□□□□ -1.59	not detected
ACT1	YFL039C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.11	□□□□□ -1.59	not detected
ACT1	YFL039C	RMP1	Q12530	201 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	REC107	P21651	314 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	AEP2	P22136	580 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SEC15	P22224	910 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	PRE4	P30657	266 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	DAL3	P32459	195 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	CCL1	P37366	393 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	CTP1	P38152	299 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SPT8	P38915	602 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	BDH2	P39713	417 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RTT105	P40063	208 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	HST1	P53685	503 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	TRS130	Q03660	1102 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	HLR1	Q04429	423 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	ABF1	P14164	731 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	HNM1	P19807	563 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	NTH1	P32356	751 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	NPL6	P32832	435 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	GLG1	P36143	616 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	YJL206C	P39529	758 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	PCL7	P40186	285 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	KHA1	P40309	873 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	HIS6	P40545	261 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	LAM5	P43560	674 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	CTR1	P49573	406 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	GTR1	Q00582	310 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	YDL073W	Q07454	984 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	YPR027C	Q12079	277 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ACT1	YFL039C	CDC43	P18898	376 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACT1	YFL039C	KIN3	P22209	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACT1	YFL039C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ACT1	YFL039C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6

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