RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.71■□□□□ 0.11
RPS6KC1-208ENST00000614059 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.71■□□□□ 0.11
RPS6KC1-208ENST00000614059 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.71■□□□□ 0.11
RPS6KC1-208ENST00000614059 SERTAD1Q9UHV2 236 aa15.71■□□□□ 0.11
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZFYVE9O95405 1425 aa15.71■□□□□ 0.11
RPS6KC1-208ENST00000614059 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRAF5O00463 557 aa15.71■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 LDHCP07864 332 aa15.71■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCNA6P17658 529 aa15.71■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 NDUFA8P51970 172 aa15.71■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 POSTNQ15063 836 aa15.71■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.71■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.71■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 ABCC1P33527 1531 aa15.71■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 AOX1Q06278 1338 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 KRT79Q5XKE5 535 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADALQ6DHV7 355 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CALML3P27482 149 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARID5BQ14865 1188 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 PICALMQ13492 652 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 MSL1Q68DK7 614 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CUL5Q93034 780 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 NBPF4Q96M43 638 aa15.7■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CUTAO60888 179 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TUBBP07437 444 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 PDE4DQ08499 809 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 COBLO75128 1261 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 C8orf74Q6P047 294 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TAF5LO75529 589 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CUL4AQ13619 759 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.69■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 IP6K1Q92551 441 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 GNAQP50148 359 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 PLS1Q14651 629 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 JAKMIP2Q96AA8 810 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 INPP5BP32019 993 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TNIP1Q15025 636 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC6Q16204 474 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 GBP6Q6ZN66 633 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 SIRT1Q96EB6 747 aa15.68■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIF4AO95239 1232 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 PTPROQ16827 1216 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLIC4Q9Y696 253 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 BTBD18B2RXH4 712 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 DEXIO95424 95 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 BICDL2A1A5D9 508 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 MAGEA1P43355 309 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TUBB4BP68371 445 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.67■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 ITGA6P23229 1130 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMTC1Q8IUR5 882 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 E9PCH4 1651 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CALM1P0DP23 149 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CALM2P0DP24 149 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 CALM3P0DP25 149 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATP5JP18859 108 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 PLCB3Q01970 1234 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCRN1Q12765 414 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 PAK1Q13153 545 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 NAA25Q14CX7 972 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM87BQ96K49 555 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 VIMP08670 466 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 C6orf50Q9HD87 102 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 RGS12O14924 1447 aa15.66■□□□□ 0.1
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms