RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16.62■□□□□ 0.25
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CTIF-211ENST00000592658 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-211ENST00000592658 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CTIF-211ENST00000592658 MRS2Q9HD23 443 aa16.62■□□□□ 0.25
CTIF-211ENST00000592658 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.62■□□□□ 0.25
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CTIF-211ENST00000592658 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.53■□□□□ 0.24
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CTIF-211ENST00000592658 GJD2Q9UKL4 321 aa16.53■□□□□ 0.24
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CTIF-211ENST00000592658 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.52■□□□□ 0.24
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CTIF-211ENST00000592658 GUCD1Q96NT3 240 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.51■□□□□ 0.23
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CTIF-211ENST00000592658 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 PNMA3Q9UL41 463 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 COL6A1P12109 1028 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-211ENST00000592658 ATP2B3Q16720 1220 aa16.49■□□□□ 0.23
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