RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	SEC24B	O95487	1268 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	FGA	P02671	866 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	USP5	P45974	858 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	NFIA	Q12857	509 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	APP	P05067	770 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	TNNI2	P48788	182 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	LAMB1	P07942	1786 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	CACNB3	P54284	484 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	NAPB	Q9H115	298 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	USP17L21	D6R901	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	TDO2	P48775	406 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	PICALM	Q13492	652 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	KCNB2	Q92953	911 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	HSPA4	P34932	840 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	RASA3	Q14644	834 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	EHD4	Q9H223	541 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-211	ENST00000582232	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.71	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.71	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	PPARA	Q07869	468 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	TCP10	Q12799	353 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF213	O14771	459 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	SLC27A2	O14975	620 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	CYP21A2	P08686	494 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	FGR	P09769	529 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	PLCD1	P51178	756 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	GABPA	Q06546	454 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	TBC1D12	O60347	775 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	CYP2D6	P10635	497 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	MCC	P23508	829 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	NT5C2	P49902	561 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	ANAPC15	P60006	121 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-211	ENST00000582232	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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