RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570519.5

NOMO3-204, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 4

Gene NOMO3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-204ENST00000570519 MAP4K1Q92918 833 aa11.64□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.64□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ZMYM6O95789 1325 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 PRKAB2O43741 272 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ENTPD3O75355 529 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 EGFRP00533 1210 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 EPHX2P34913 555 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 VPS53Q5VIR6 699 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 WDR90Q96KV7 1748 aa11.63□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 FGAP02671 866 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 USP5P45974 858 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 PTH1RQ03431 593 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 SBK1Q52WX2 424 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 FAM83AQ86UY5 434 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 IFNL3Q8IZI9 196 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 USP26Q9BXU7 913 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.62□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.61□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 CLRN2A0PK11 232 aa11.61□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 SEC24BO95487 1268 aa11.61□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 APPP05067 770 aa11.61□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 NFIAQ12857 509 aa11.61□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TNFAIP1Q13829 316 aa11.61□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.61□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 FLT1P17948 1338 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TNNI2P48788 182 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 NECTIN1Q15223 517 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 FAM151AQ8WW52 585 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 KCNB2Q92953 911 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 NAPBQ9H115 298 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 RRAGCQ9HB90 399 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 SCN4AP35499 1836 aa11.6□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 CNTNAP1P78357 1384 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 USP17L12C9JPN9 530 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 USP17L21D6R901 530 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TDO2P48775 406 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 CACNB3P54284 484 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 CTR9Q6PD62 1173 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 VEZTQ9HBM0 779 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 GGA3Q9NZ52 723 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
NOMO3-204ENST00000570519 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 HSPA4P34932 840 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 PICALMQ13492 652 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 RASA3Q14644 834 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 C12orf60Q5U649 245 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 TTC6Q86TZ1 520 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 ZFPM1Q8IX07 1006 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 IL17RAQ96F46 866 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.58□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 SLC27A2O14975 620 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 FGRP09769 529 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 MCCP23508 829 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 MAP3K10Q02779 954 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 PPARAQ07869 468 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 TCP10Q12799 353 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 RNF20Q5VTR2 975 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 CREB3L3Q68CJ9 461 aa11.57□□□□□ -0.56
NOMO3-204ENST00000570519 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms