RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 TSPY4P0CV99 314 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TSPY10P0CW01 314 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SLC8A1P32418 973 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 MPP3Q13368 585 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 RCN1Q15293 331 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 PARP10Q53GL7 1025 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 BRAPQ7Z569 592 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CCDC82Q8N4S0 544 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 KIAA1524Q8TCG1 905 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TAOK3Q9H2K8 898 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM165Q9HC07 324 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 WDR70Q9NW82 654 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 DKK3Q9UBP4 350 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SLC27A2O14975 620 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 EVI5O60447 810 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TBCAO75347 108 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 FERP16591 822 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ARPC4P59998 168 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ZBED6P86452 979 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 NUCB1Q02818 461 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CUL4BQ13620 913 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ELF2Q15723 593 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CNGA3Q16281 694 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 PKN1Q16512 942 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 FXNQ16595 210 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 MSL1Q68DK7 614 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TEKT4Q8WW24 435 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TBC1D5Q92609 795 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 PMM1Q92871 262 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 NACC2Q96BF6 587 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SPDL1Q96EA4 605 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 IFT57Q9NWB7 429 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TBC1D7Q9P0N9 293 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SEL1LQ9UBV2 794 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 COG6Q9Y2V7 657 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TET3O43151 1660 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 INSRP06213 1382 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 KIF15Q9NS87 1388 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 RTN2O75298 545 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 LMNB1P20700 586 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 INPP5BP32019 993 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF131P52739 623 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 ZBTB17Q13105 803 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 INAQ16352 499 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 GNPTABQ3T906 1256 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 WLSQ5T9L3 541 aa5.05□□□□□ -1.6
C15orf40-210ENST00000563387 NUGGCQ68CJ6 796 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms