RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ESR2Q92731 530 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1W2PQ27 194 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1W2PQ64 194 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1W2PQD8 194 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NTRK3Q16288 839 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CNBD1Q8NA66 436 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP25Q9UHP3 1055 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.82■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFIXQ14938 502 aa24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADALQ6DHV7 355 aa24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KINO60870 393 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFNAR1P17181 557 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RXRAP19793 462 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRAPQ13588 217 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLRK1P26718 216 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RTN1Q16799 776 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT40Q6A162 431 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FSIP1Q8NA03 581 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.8■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADCY5O95622 1261 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP2R5BQ15173 497 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHKBQ93100 1093 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.79■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MECOMQ03112 1051 aa24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANO1Q5XXA6 986 aa24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYL10Q9BUA6 226 aa24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.78■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPTLC2O15270 562 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSPA1LP34931 641 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLIC4Q9Y696 253 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF28PB7ZC32 967 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF384Q8TF68 577 aa24.77■■□□□ 1.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.76■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGRP09769 529 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XDHP47989 1333 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AIFM3Q96NN9 605 aa24.75■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ST5P78524 1137 aa24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEC23AQ15436 765 aa24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTR9Q6PD62 1173 aa24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JMYQ8N9B5 988 aa24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FANCBQ8NB91 859 aa24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNKSO95271 1327 aa24.74■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DEXIO95424 95 aa24.73■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IQCA1Q86XH1 822 aa24.73■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CBX8Q9HC52 389 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms