RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.1■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.1■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 ZNF521Q96K83 1311 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 CXCL11O14625 94 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PICALMQ13492 652 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PICK1Q9NRD5 415 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.09■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 ADCY3O60266 1144 aa20.08■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PTPRAP18433 802 aa20.08■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 FLT3LGP49771 235 aa20.08■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.08■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CS-227ENST00000551441 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.08■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 TRIM75PA6NK02 468 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 INHAP05111 366 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 ABCF2Q9UG63 623 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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CS-227ENST00000551441 SGPL1O95470 568 aa20.06■□□□□ 0.8
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CS-227ENST00000551441 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 DEFB118Q96PH6 123 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 PTPRFP10586 1907 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 TIMM10P62072 90 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 CCDC102BQ68D86 513 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 BTDP43251 543 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 TREML2Q5T2D2 321 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 IDI2Q9BXS1 227 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 DOCK1Q14185 1865 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 ENTPD3O75355 529 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 CIAO1O76071 339 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 PRO3102Q9H379 93 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 GAKO14976 1311 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 EVI5O60447 810 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 RASGRF1Q13972 1273 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 STAP2Q9UGK3 403 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-227ENST00000551441 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 E9PSI1 815 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 LRCH3Q96II8 777 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 ALPK3Q96L96 1907 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 SEMA3EO15041 775 aa20■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 SLFN5Q08AF3 891 aa20■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 MAP3K10Q02779 954 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 MECOMQ03112 1051 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 COA7Q96BR5 231 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa19.99■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 COL6A3P12111 3177 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 TFCP2Q12800 502 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 TRIM32Q13049 653 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 SPP2Q13103 211 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 PI16Q6UXB8 463 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 PXYLP1Q8TE99 480 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 ZNF384Q8TF68 577 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 XAGE2Q96GT9 111 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 MEIS3Q99687 375 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 FBXO3Q9UK99 471 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa19.98■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GUL7 405 aa19.97■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 PEX10O60683 326 aa19.97■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 RHBDL3P58872 404 aa19.97■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 IRF5Q13568 498 aa19.97■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.97■□□□□ 0.79
CS-227ENST00000551441 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.97■□□□□ 0.79
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