RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 RHBDL3P58872 404 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 TTC6Q86TZ1 520 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 FAM83AQ86UY5 434 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-220ENST00000550700 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 FGAP02671 866 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PSMA5P28066 241 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 NECTIN1Q15223 517 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 KCNB2Q92953 911 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 LAMB1P07942 1786 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 WNT10BO00744 389 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 HLA-DOAP06340 250 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PTH1RQ03431 593 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PDE4BQ07343 736 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 TRDNQ13061 729 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 IL17RAQ96F46 866 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 FLT1P17948 1338 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 SEC24BO95487 1268 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 CHGBP05060 677 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 VPS53Q5VIR6 699 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 CREB3L3Q68CJ9 461 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 FAM151AQ8WW52 585 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 KRT23Q9C075 422 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 EHD4Q9H223 541 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 IL25Q9H293 177 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 USP17L12C9JPN9 530 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 USP17L21D6R901 530 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PRKAB2O43741 272 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 EPHX2P34913 555 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 EPS15P42566 896 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PPARAQ07869 468 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 C12orf60Q5U649 245 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 CTR9Q6PD62 1173 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 MTA3Q9BTC8 594 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 SWAP70Q9UH65 585 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 MYH8P13535 1937 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 SLC27A2O14975 620 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 RABEP1Q15276 862 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 NCOA7Q8NI08 942 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 VEZTQ9HBM0 779 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 FOXP2O15409 715 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-220ENST00000550700 TBC1D12O60347 775 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms