RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548421.2

BRF1-213, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BRF1, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-213ENST00000548421 WNT10BO00744 389 aa34.21■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 MYO1BO43795 1136 aa34.21■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 PICALMQ13492 652 aa34.21■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 CTR9Q6PD62 1173 aa34.21■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 TMOD2Q9NZR1 351 aa34.21■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 USP17L12C9JPN9 530 aa34.2■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 USP17L21D6R901 530 aa34.2■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 KRT32Q14532 448 aa34.2■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 SBK1Q52WX2 424 aa34.2■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
BRF1-213ENST00000548421 NFIAQ12857 509 aa34.2■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa34.2■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 SPDYE2Q495Y8 402 aa34.2■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 SAMD7Q7Z3H4 446 aa34.2■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 AMOTL1Q8IY63 956 aa34.2■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 TAF6LQ9Y6J9 622 aa34.2■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 MINDY4BA8MYZ0 360 aa34.19■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 NPM3O75607 178 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 PPARAQ07869 468 aa34.19■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 GLTPD2A6NH11 291 aa34.18■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 EGFRP00533 1210 aa34.18■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 CACNB3P54284 484 aa34.18■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 NBPF9Q3BBW0 867 aa34.18■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 ANAPC4Q9UJX5 808 aa34.18■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 NBPF3Q9H094 633 aa34.17■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 CLRN2A0PK11 232 aa34.16■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 EPS15P42566 896 aa34.16■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 FAM198AQ9UFP1 575 aa34.16■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa34.15■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 E7EWF7 191 aa34.15■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 RABEP1Q15276 862 aa34.15■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 ADCK5Q3MIX3 580 aa34.15■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 SCN4AP35499 1836 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 PSMA5P28066 241 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 C12orf60Q5U649 245 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 FKBP1CQ5VVH2 108 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 STOX1Q6ZVD7 989 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 TBC1D10CQ8IV04 446 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 TM6SF1Q9BZW5 370 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 ENTPD3O75355 529 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 CYP2D6P10635 497 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 CTDSPL2Q05D32 466 aa34.14■■■■□ 3.06
BRF1-213ENST00000548421 TRPM4Q8TD43 1214 aa34.13■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 VEZTQ9HBM0 779 aa34.13■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 WDR90Q96KV7 1748 aa34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 ROBO3Q96MS0 1386 aa34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 TCP10Q12799 353 aa34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 AKNAD1Q5T1N1 836 aa34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 STAG1Q8WVM7 1258 aa34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 CASTP20810 708 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 NEK1Q96PY6 1258 aa34.11■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 TCP10L2B9ZVM9 353 aa34.1■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 TTC6Q86TZ1 520 aa34.1■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 PLCD1P51178 756 aa34.09■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 EVX2Q03828 476 aa34.09■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 MFSD6Q6ZSS7 791 aa34.09■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 ZFPM1Q8IX07 1006 aa34.09■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa34.09■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 HACL1Q9UJ83 578 aa34.09■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 SMIM22K7EJ46 135 aa34.08■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 PCP11498 1178 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 TRDNQ13061 729 aa34.08■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 FAM83AQ86UY5 434 aa34.08■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 HLA-DOAP06340 250 aa34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 NCOA7Q8NI08 942 aa34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 FAM151AQ8WW52 585 aa34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 CNNM2Q9H8M5 875 aa34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 CNTNAP1P78357 1384 aa34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 ATRNL1Q5VV63 1379 aa34.07■■■■□ 3.05
BRF1-213ENST00000548421 NEDD4P46934 1319 aa34.07■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 TNNI2P48788 182 aa34.07■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 TNFAIP1Q13829 316 aa34.07■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 STK11IPQ8N1F8 1099 aa34.07■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 IL27Q8NEV9 243 aa34.07■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 SIPA1L1O43166 1804 aa34.07■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 IQCA1LA6NCM1 817 aa34.06■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
BRF1-213ENST00000548421 PDE4BQ07343 736 aa34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms