RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 PAOXQ6QHF9 649 aa7.78□□□□□ -1.16
TRDN-205ENST00000546248 CCNJLQ8IV13 435 aa7.78□□□□□ -1.16
TRDN-205ENST00000546248 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.78□□□□□ -1.16
TRDN-205ENST00000546248 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.78□□□□□ -1.16
TRDN-205ENST00000546248 TCF12Q99081 682 aa7.78□□□□□ -1.16
TRDN-205ENST00000546248 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.78□□□□□ -1.16
TRDN-205ENST00000546248 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 PCDH1Q08174 1060 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ABI1Q8IZP0 508 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
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TRDN-205ENST00000546248 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 RNF114Q9Y508 228 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 DAPK1P53355 1430 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 AKNAQ7Z591 1439 aa7.77□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ROCK1Q13464 1354 aa7.76□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ADH5P11766 374 aa7.76□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.76□□□□□ -1.17
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TRDN-205ENST00000546248 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.76□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.76□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.76□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 SHROOM2Q13796 1616 aa7.75□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.75□□□□□ -1.17
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TRDN-205ENST00000546248 MAOBP27338 520 aa7.75□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ECM1Q16610 540 aa7.75□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ZAR1Q86SH2 424 aa7.75□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.75□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.75□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.75□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 FAM170BA6NMN3 283 aa7.74□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 POU4F3Q15319 338 aa7.74□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.74□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 PRNPP04156 253 aa7.73□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 CHD1O14646 1710 aa7.72□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 NCOA1Q15788 1441 aa7.72□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 CYP26A1O43174 497 aa7.72□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 NFICP08651 508 aa7.72□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 RAB6AP20340 208 aa7.72□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP4P98171 946 aa7.72□□□□□ -1.17
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TRDN-205ENST00000546248 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.72□□□□□ -1.17
TRDN-205ENST00000546248 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 B3GALT4O96024 378 aa7.71□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 CYP11A1P05108 521 aa7.71□□□□□ -1.18
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF576Q9H609 170 aa7.71□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.71□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.71□□□□□ -1.18
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TRDN-205ENST00000546248 ABCC2Q92887 1545 aa7.7□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 DYMQ7RTS9 669 aa7.7□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.7□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 KDM6BO15054 1643 aa7.7□□□□□ -1.18
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TRDN-205ENST00000546248 ADGRL2O95490 1459 aa7.69□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 MBD5Q9P267 1494 aa7.69□□□□□ -1.18
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TRDN-205ENST00000546248 TSPY10P0CW01 314 aa7.69□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 ORC1Q13415 861 aa7.69□□□□□ -1.18
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TRDN-205ENST00000546248 CBLL1Q75N03 491 aa7.69□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
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TRDN-205ENST00000546248 RAD18Q9NS91 495 aa7.69□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.69□□□□□ -1.18
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TRDN-205ENST00000546248 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.68□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.68□□□□□ -1.18
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TRDN-205ENST00000546248 FBXL18Q96ME1 805 aa7.68□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 CORO1BQ9BR76 489 aa7.68□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 EHD4Q9H223 541 aa7.68□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.68□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.68□□□□□ -1.18
TRDN-205ENST00000546248 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.68□□□□□ -1.18
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