RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 SHTN1A0MZ66 631 aa14.23□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 CYP21A2P08686 494 aa14.23□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 PICALMQ13492 652 aa14.23□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.23□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.23□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 IL17RAQ96F46 866 aa14.23□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.23□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.23□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 MYH1P12882 1939 aa14.23□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 USP17L21D6R901 530 aa14.22□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 ENTPD3O75355 529 aa14.22□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 PSMA5P28066 241 aa14.22□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 TNFAIP1Q13829 316 aa14.22□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 CTR9Q6PD62 1173 aa14.22□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 IL27Q8NEV9 243 aa14.22□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 HACL1Q9UJ83 578 aa14.22□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 PALD1Q9ULE6 856 aa14.22□□□□□ -0.13
LMO3-218ENST00000538020 SCN4AP35499 1836 aa14.22□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 EPS15P42566 896 aa14.21□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.21□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 RASEFQ8IZ41 740 aa14.21□□□□□ -0.13
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LMO3-218ENST00000538020 TCP10Q12799 353 aa14.19□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.19□□□□□ -0.14
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LMO3-218ENST00000538020 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 NCOA7Q8NI08 942 aa14.19□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 NEK1Q96PY6 1258 aa14.19□□□□□ -0.14
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LMO3-218ENST00000538020 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.19□□□□□ -0.14
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LMO3-218ENST00000538020 CYP2D6P10635 497 aa14.18□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 EPHX2P34913 555 aa14.18□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.18□□□□□ -0.14
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LMO3-218ENST00000538020 KRT23Q9C075 422 aa14.18□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 NBPF3Q9H094 633 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 EHD4Q9H223 541 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 TOMM22Q9NS69 142 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 GGA3Q9NZ52 723 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.17□□□□□ -0.14
LMO3-218ENST00000538020 SWAP70Q9UH65 585 aa14.17□□□□□ -0.14
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