RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534404.1

LRP4-205, Transcript of LDL receptor related protein 4, human

TSL 5

Gene LRP4, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP4-205	ENST00000534404	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		40.34	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	BAG3	O95817	575 aa		40.33	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	ERO1B	Q86YB8	467 aa		40.33	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		40.33	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		40.32	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	GTF2A2	P52657	109 aa		40.32	■■■■■ 4.05
LRP4-205	ENST00000534404	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	40.31	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	INPP5B	P32019	993 aa		40.31	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	IGSF3	O75054	1194 aa		40.3	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	TEX11	Q8IYF3	940 aa		40.3	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	ABHD8	Q96I13	439 aa		40.3	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		40.3	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	40.3	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		40.3	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		40.29	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		40.29	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		40.29	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	GPR25	O00155	361 aa		40.28	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	40.28	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		40.28	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		40.27	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	PLCG2	P16885	1265 aa		40.27	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	CCL15	Q16663	113 aa		40.27	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		40.27	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	LAMB1	P07942	1786 aa		40.27	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	DOCK2	Q92608	1830 aa		40.26	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.04
LRP4-205	ENST00000534404	CYP7A1	P22680	504 aa		40.25	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	PTPN18	Q99952	460 aa		40.25	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		40.25	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	PPAT	Q06203	517 aa		40.24	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	PPIL2	Q13356	520 aa		40.24	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		40.24	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	IRF6	O14896	467 aa		40.23	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	MAP3K12	Q12852	859 aa		40.23	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		40.23	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		40.23	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		40.23	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	40.23	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	FKTN	O75072	461 aa		40.22	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	CETP	P11597	493 aa		40.22	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	PPP4C	P60510	307 aa		40.22	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	SNAPC2	Q13487	334 aa		40.22	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		40.22	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		40.22	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
LRP4-205	ENST00000534404	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		40.19	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	40.19	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	PICK1	Q9NRD5	415 aa		40.19	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		40.18	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	CRHR2	Q13324	411 aa		40.18	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	40.18	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	SLURP2	P0DP57	97 aa		40.17	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	MAP3K10	Q02779	954 aa		40.17	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		40.17	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		40.16	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		40.16	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		40.16	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	GOLIM4	O00461	696 aa		40.15	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	TBC1D12	O60347	775 aa		40.14	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	40.14	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	CERS3	Q8IU89	383 aa		40.14	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		40.14	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	40.14	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		40.14	■■■■■ 4.02
LRP4-205	ENST00000534404	FAM196B	A6NMK8	535 aa		40.13	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		40.13	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	DCTPP1	Q9H773	170 aa		40.12	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		40.12	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	FLT1	P17948	1338 aa		40.12	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		40.11	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	BTBD19	C9JJ37	291 aa		40.1	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	ATP5J	P18859	108 aa		40.1	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	USP5	P45974	858 aa		40.1	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		40.1	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		40.1	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	PTPRA	P18433	802 aa		40.09	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	CRBN	Q96SW2	442 aa		40.09	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		40.09	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		40.08	■■■■■ 4.01
LRP4-205	ENST00000534404	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		40.08	■■■■■ 4.01

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