RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 RAD21O60216 631 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CERKQ8TCT0 537 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ITFG2Q969R8 447 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 WTAPQ15007 396 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 IQCA1Q86XH1 822 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 DACT1Q9NYF0 836 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 BECN2A8MW95 431 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 UBE4AQ14139 1066 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 TMTC2Q8N394 836 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PHKBQ93100 1093 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PFKFB2O60825 505 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC192P0DO97 292 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 GNAT2P19087 354 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 TERF2Q15554 542 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K11Q16584 847 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 LCORLQ8N3X6 602 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ALG1Q9BT22 464 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 KRT23Q9C075 422 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 RBSNQ9H1K0 784 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC96Q2M329 555 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 TTC6Q86TZ1 520 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 TSPY2A6NKD2 308 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 F8W031 263 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 UFL1O94874 794 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ESR2Q92731 530 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 DISP2A7MBM2 1401 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 RIMBP2O15034 1052 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 BORCS6Q96GS4 357 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 SUFUQ9UMX1 484 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.04□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 APBA3O96018 575 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 KCNB2Q92953 911 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 USP25Q9UHP3 1055 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L12C9JPN9 530 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L21D6R901 530 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 XBP1P17861 261 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF445P59923 1031 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 NFIXQ14938 502 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 KIF3CO14782 793 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 RTN1Q16799 776 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 FSIP1Q8NA03 581 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 FAM210AQ96ND0 272 aa9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PHLPP1O60346 1717 aa9.02□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.02□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC189A1A4V9 331 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINB2P05120 415 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
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