RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 SLFNL1Q499Z3 407 aa13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 A0A0D9SFI3 127 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 ADM5C9JUS6 153 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CHGBP05060 677 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 TDO2P48775 406 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 NFIAQ12857 509 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 FAM198AQ9UFP1 575 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 FLT1P17948 1338 aa13.32□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 DCAF15Q66K64 600 aa13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 TTC6Q86TZ1 520 aa13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 SDR42E1Q8WUS8 393 aa13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CDCA5Q96FF9 252 aa13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CSRNP1Q96S65 589 aa13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM39BQ9GZU3 492 aa13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 MCM9Q9NXL9 1143 aa13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 PRKAB2O43741 272 aa13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 NAPBQ9H115 298 aa13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CNTNAP1P78357 1384 aa13.3□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 SGSM2O43147 1006 aa13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 IFNL3Q8IZI9 196 aa13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 PI4KBQ9UBF8 816 aa13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 GSG1L2A8MUP6 293 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 TRAF5O00463 557 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 FKBP1BP68106 108 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 DSCC1Q9BVC3 393 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF287Q9HBT7 754 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 PALD1Q9ULE6 856 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 ATRNL1Q5VV63 1379 aa13.28□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.27□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 ZFPM1Q8IX07 1006 aa13.27□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 TEPSINQ96N21 525 aa13.27□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF341Q9BYN7 854 aa13.27□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 MINDY4BA8MYZ0 360 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 USP17L12C9JPN9 530 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 USP17L21D6R901 530 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 REC8O95072 547 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 ZMYM6O95789 1325 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 ALX1Q15699 326 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 SBK1Q52WX2 424 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 FOCADQ5VW36 1801 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 NAV1Q8NEY1 1877 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 PASKQ96RG2 1323 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 EHD4Q9H223 541 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 SWAP70Q9UH65 585 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 SERPINB13Q9UIV8 391 aa13.26□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF213O14771 459 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 TBC1D12O60347 775 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 PRKG1Q13976 671 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 VPS53Q5VIR6 699 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 CTR9Q6PD62 1173 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 MIGA2Q7L4E1 593 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa13.25□□□□□ -0.29
ITGA3-210ENST00000507771 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms