RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 CNGA1P29973 690 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 NEUROD1Q13562 356 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 FAM182BQ5T319 152 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 VHLLQ6RSH7 139 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 MFSD3Q96ES6 412 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ADAM19Q9H013 955 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 FAM187AA6NFU0 413 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 GFRA2O00451 464 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 DNAJA2O60884 412 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CPB1P15086 417 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 STAT3P40763 770 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 HGSNATQ68CP4 663 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 NIM1KQ8IY84 436 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 NINJ1Q92982 152 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SGSM3Q96HU1 749 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 A0A087X0B3 334 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SUSD5O60279 629 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 EPHA1P21709 976 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CTBSQ01459 385 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PERM1Q5SV97 790 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SYT9Q86SS6 491 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 FAM35AQ86V20 835 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ECEL1O95672 775 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 AP3B2Q13367 1082 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 IKBKEQ14164 716 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 INPP5AQ14642 412 aa6.79□□□□□ -1.32
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HERC3-209ENST00000504994 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ATG4CQ96DT6 458 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CEP89Q96ST8 783 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 GMIPQ9P107 970 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 TBX4P57082 545 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SLC9A7Q96T83 725 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 TNFRSF10CO14798 259 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PEX14O75381 377 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 RNF180Q86T96 592 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 UBR7Q8N806 425 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 EXOC2Q96KP1 924 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.77□□□□□ -1.33
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