RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496447.5

PTPRF-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 5,887 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-215ENST00000496447 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
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PTPRF-215ENST00000496447 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.76□□□□□ -0.05
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PTPRF-215ENST00000496447 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.052e-7■■□□□ 12
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PTPRF-215ENST00000496447 KIFAP3Q92845 792 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-215ENST00000496447 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-215ENST00000496447 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-215ENST00000496447 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-215ENST00000496447 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRF-215ENST00000496447 NDC80O14777 642 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-215ENST00000496447 PHKG2P15735 406 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRF-215ENST00000496447 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.71□□□□□ -0.05
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