RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494126.6

PHYKPL-211, Transcript of 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PHYKPL, Length 2,297 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYKPL-211ENST00000494126 CTR9Q6PD62 1173 aa28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 NPR1P16066 1061 aa28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 MRE11P49959 708 aa28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 MTA3Q9BTC8 594 aa28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 GRPEL1Q9HAV7 217 aa28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.96■■■□□ 2.23
PHYKPL-211ENST00000494126 ZBTB43O43298 467 aa28.95■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 RXRAP19793 462 aa28.95■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 TTC6Q86TZ1 520 aa28.95■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 MICU3Q86XE3 530 aa28.95■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 LAMB1P07942 1786 aa28.94■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.94■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 PDE6BP35913 854 aa28.94■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.94■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ELP1O95163 1332 aa28.93■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 USP17L12C9JPN9 530 aa28.93■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 USP17L21D6R901 530 aa28.93■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 C6orf229H3BNL8 230 aa28.93■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 CDC27P30260 824 aa28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ESR2Q92731 530 aa28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 MYL10Q9BUA6 226 aa28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 CCDC69A6NI79 296 aa28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 FGRP09769 529 aa28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 SLC12A7Q9Y666 1083 aa28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 NID2Q14112 1375 aa28.92■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 GSTO1P78417 241 aa28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 WTAPQ15007 396 aa28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 MYH15Q9Y2K3 1946 aa28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 GUCY1B3Q02153 619 aa28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.9■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ERICH2A1L162 156 aa28.9■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ALDH1B1P30837 517 aa28.9■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.9■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 SYCE3A1L190 88 aa28.89■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 CDKL5O76039 1030 aa28.89■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 EVX2Q03828 476 aa28.89■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 MASTLQ96GX5 879 aa28.89■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 C8orf76Q96K31 380 aa28.89■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.89■■■□□ 2.22
PHYKPL-211ENST00000494126 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.89■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 NTRK3Q16288 839 aa28.89■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.89■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 SBK1Q52WX2 424 aa28.89■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 SLC15A2Q16348 729 aa28.88■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 OLFM4Q6UX06 510 aa28.88■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 SPATA32Q96LK8 384 aa28.88■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa28.88■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 SEC23AQ15436 765 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 TMTC2Q8N394 836 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 PRDM1O75626 825 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 TNKSO95271 1327 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 LDHCP07864 332 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 PPP4CP60510 307 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 PANK2Q9BZ23 570 aa28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 CYP2D6P10635 497 aa28.86■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 BAG3O95817 575 aa28.86■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.86■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 LRSAM1Q6UWE0 723 aa28.86■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.85■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.85■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 MPNDQ8N594 471 aa28.85■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 ORC4O43929 436 aa28.85■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 RCAN1P53805 252 aa28.85■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.85■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 PHKBQ93100 1093 aa28.85■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 RIMBP2O15034 1052 aa28.84■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 CCDC183Q5T5S1 534 aa28.84■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 COA1Q9GZY4 146 aa28.84■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.84■■■□□ 2.21
PHYKPL-211ENST00000494126 CFAP45Q9UL16 551 aa28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms